抗菌剂长期或不规范使用可致耐药菌产生且不同人群感染风险有别，还会破坏肠道菌群平衡引发肠道功能紊乱，部分个体用后有过敏反应，某些具肾毒性可致肾功能异常老人风险高，部分经肝代谢长期或大剂量用或有基础肝病者易致肝功能异常需评估监测。
一、耐药菌产生
长期或不规范使用抗菌剂会诱导细菌发生基因突变或获得外源性耐药基因，促使耐药菌株逐渐增多。例如，金黄色葡萄球菌对甲氧西林的耐药率逐年上升，使得针对该菌感染的治疗药物选择受限，影响感染性疾病的有效控制。不同年龄人群中，长期住院、反复接受抗菌剂治疗的患者耐药菌感染风险更高，儿童因免疫系统发育不完善且可能存在不合理用药情况，也易受耐药菌威胁。
二、肠道菌群失调
抗菌剂在杀灭致病菌群时，会非特异性地破坏肠道正常菌群平衡，导致益生菌（如双歧杆菌、乳酸杆菌等）数量锐减，有害菌（如大肠杆菌、克雷伯菌等）相对增殖。这可引发腹泻、便秘、腹胀等肠道功能紊乱症状，婴幼儿肠道菌群处于建立和不稳定阶段，使用抗菌剂后更易出现严重肠道菌群失调，表现为频繁水样便等，需关注其肠道微生态恢复情况。
三、过敏反应
部分个体对抗菌剂存在过敏体质，使用后可能迅速出现过敏症状，轻者表现为皮疹、瘙痒、药物热等，重者可发生呼吸困难、喉头水肿、过敏性休克等危及生命的情况。不同性别对过敏的易感性无绝对差异，但个体遗传因素决定了过敏风险，有药物过敏史人群使用抗菌剂时需高度警惕，用药过程中要密切观察过敏相关表现。
四、肾脏损害
某些抗菌剂具有肾毒性，例如氨基糖苷类抗菌剂可通过损伤肾小管上皮细胞，影响肾脏的滤过和重吸收功能，导致肌酐升高、尿量改变等肾功能异常表现。老年人肾功能随年龄增长逐渐减退，使用具有肾毒性抗菌剂时肾脏损害风险增加，需定期监测肾功能指标，如血肌酐、尿素氮等。
五、肝脏损害
部分抗菌剂经肝脏代谢，长期或大剂量使用可能引起肝功能异常，表现为血清转氨酶（如谷丙转氨酶、谷草转氨酶）升高、胆红素代谢紊乱等。有基础肝脏疾病（如肝炎、肝硬化）的患者使用抗菌剂后，肝脏代谢负担加重，肝功能损害风险更高，用药前需评估患者肝脏功能状态，用药过程中监测肝功能变化。
