体格检查包括一般状况（身高体重反映发育营养、血压知心血管情况）、皮肤（查看有无皮疹等及不同人群表现）、淋巴结（检查浅表淋巴结大小质地活动度等）、外生殖器检查（阴茎观外观形态等，阴囊查皮肤及睾丸附睾等）、肛门直肠检查（肛门看周围病变，直肠指诊了解情况）、前列腺检查（指诊摸大小质地等）、实验室检查（血常规助判感染贫血等，尿常规帮诊泌尿疾病，精液常规查生育等情况）、影像学检查（泌尿系统超声查结构异常，阴囊超声检阴囊内病变）。
一般状况：包括身高、体重、血压等，身高体重可反映身体发育及营养状况，血压能初步了解心血管系统基本情况，不同年龄、性别人群正常范围不同，如成年男性收缩压正常范围多在90~139mmHg，舒张压在60~89mmHg。
皮肤：查看皮肤有无皮疹、出血点、溃疡等，不同生活方式人群皮肤表现可能不同，长期户外工作者可能因紫外线暴露出现皮肤色泽改变等，有特殊病史人群如皮肤病患者皮肤表现更具特异性。
淋巴结：检查全身浅表淋巴结，如颈部、腋窝、腹股沟等部位淋巴结大小、质地、活动度等，淋巴结异常可能提示感染、肿瘤等疾病。
外生殖器检查
阴茎：观察阴茎的外观，包括阴茎的大小、形态，有无畸形、尿道开口异常等，不同年龄男性阴茎发育不同，儿童期阴茎较小，青春期后逐渐发育成熟，成年男性阴茎长度一般在疲软状态下约4~10cm，勃起时可延长1倍左右。
阴囊：检查阴囊皮肤有无红肿、皮疹，阴囊内睾丸、附睾的大小、质地、有无结节等，睾丸是生精和分泌雄激素的重要器官，正常睾丸左右略有差异，附睾是储存精子和促使精子成熟的部位，如有隐睾等情况需及时发现处理。
肛门直肠检查
肛门：查看肛门周围皮肤有无病变，如痔疮、肛裂等，长期便秘人群易患痔疮，检查时可戴手套进行指诊初步评估肛门括约肌张力等情况。
直肠：进行直肠指诊，了解直肠有无肿块、狭窄等，直肠指诊是发现直肠肿瘤等疾病的重要方法，对于男性还可了解前列腺情况。
前列腺检查
前列腺指诊：通过直肠指诊触摸前列腺的大小、质地、有无结节等，正常前列腺大小约栗子大小，质地韧，有疾病时可出现大小、质地改变，如前列腺增生时前列腺可能增大，前列腺癌时可触及结节等，不同年龄男性前列腺状况不同，老年男性前列腺增生发生率较高。
实验室检查
血常规：了解白细胞、红细胞、血小板等指标，可辅助判断有无感染、贫血等情况，不同性别、年龄人群血常规正常参考值有差异，如儿童白细胞计数较成人稍高。
尿常规：检查尿液中有无红细胞、白细胞、蛋白质等，可帮助诊断泌尿系统感染、结石、肾炎等疾病，留取尿液时需注意清洁，女性留取尿液时要避免月经血污染等。
精液常规检查：对于有生育需求或怀疑精液异常的男性，检查精液量、精子密度、活力、形态等，精液常规检查前需禁欲2~7天，不同年龄男性精液质量有变化，随着年龄增长精液质量可能逐渐下降。
影像学检查
泌尿系统超声：可检查肾脏、输尿管、膀胱、前列腺等结构有无异常，如肾结石、肾囊肿、前列腺增生等，超声检查无辐射，适合各年龄段男性，儿童检查时需注意适度约束等。
阴囊超声：对阴囊内睾丸、附睾等病变进行检查，如睾丸附睾炎、睾丸扭转等，阴囊超声能清晰显示阴囊内组织结构，帮助明确病变性质。
