唇腭裂主要由遗传因素与环境因素共同作用导致，遗传因素占比约20%~30%，环境因素包括孕期感染、药物、辐射、营养不良等，多在孕期前12周胚胎发育关键期影响面部结构形成。
遗传因素方面，若家族中有唇腭裂患者，后代发病风险显著升高，常染色体显性或隐性遗传模式可能参与其中，需结合家族史进行遗传咨询。
环境因素中，孕期感染如风疹病毒、巨细胞病毒感染可能干扰胚胎发育；接触某些药物如抗癫痫药、激素类药物，或过量饮酒、吸烟，均会增加患病几率。
营养缺乏，尤其是叶酸不足，会影响胚胎细胞增殖与分化，导致面部发育异常；孕期暴露于高剂量辐射，如医疗放射检查，也可能增加发病风险。
预防措施包括孕前及孕期补充叶酸，避免接触有害物质，定期产检监测胚胎发育，有家族史者建议进行遗传咨询与基因检测，降低后代发病风险。
