引起单纯性甲状腺肿的病因包括碘缺乏、碘过量、致甲状腺肿物质、先天性甲状腺激素合成障碍及其他因素，碘缺乏时甲状腺激素合成少致垂体分泌促甲状腺激素增加刺激甲状腺增生，碘过量抑制甲状腺激素有机化致合成减少，食物和药物中的致甲状腺肿物质可引发，先天性因基因缺陷致激素合成障碍，遗传、环境及青春期、妊娠期、哺乳期等也与之相关。
1.碘缺乏：
原因：碘是合成甲状腺激素的重要原料，当人体长期摄入碘不足时，甲状腺激素合成减少，通过负反馈调节促使垂体分泌促甲状腺激素（TSH）增加，刺激甲状腺滤泡上皮细胞增生肥大，从而引起甲状腺肿大。例如，在一些远离海洋的内陆地区，土壤、水和食物中碘含量较低，居民长期处于碘缺乏状态，单纯性甲状腺肿的发病率较高。
对不同人群的影响：儿童处于生长发育阶段，对碘的需求量大，若碘缺乏会严重影响其甲状腺激素的合成，进而影响生长发育，尤其是脑发育；孕妇碘缺乏除了会导致自身甲状腺肿外，还可能影响胎儿的甲状腺发育和智力发育。
2.碘过量：
原因：短期内摄入大量碘，可抑制甲状腺激素的有机化过程，使甲状腺激素合成减少，导致甲状腺肿。例如，长期服用含碘药物（如胺碘酮等），或食用含碘量过高的食物（如大量食用海带等海产品），都可能引起碘过量从而导致单纯性甲状腺肿。
特殊人群注意事项：本身甲状腺功能正常的人群长期过量摄入碘可能引发单纯性甲状腺肿，而对于已有甲状腺疾病的人群，如本身存在甲状腺自身免疫性疾病的患者，碘过量可能会加重病情，因此这类人群更需严格控制碘的摄入量。
3.致甲状腺肿物质：
食物中的致甲状腺肿物质：某些食物中含有致甲状腺肿的物质，如木薯中含有氰化物，在肠道内被分解为硫氰酸盐，抑制甲状腺摄取碘；卷心菜、油菜、白菜等蔬菜中含有硫代葡萄糖苷，可水解为硫氰酸盐，影响甲状腺对碘的利用。长期大量食用这些食物可能会引起甲状腺肿。
药物中的致甲状腺肿物质：一些药物也可能导致甲状腺肿，如硫脲类药物、磺胺类药物等，它们通过不同的机制干扰甲状腺激素的合成或代谢，从而引起甲状腺肿大。
对不同人群的影响：儿童长期食用含致甲状腺肿物质的食物可能影响其正常的生长发育，因为甲状腺激素对儿童的生长发育至关重要；老年人由于机体功能衰退，对致甲状腺肿物质的代谢能力下降，更容易受到其影响而发生甲状腺肿。
4.先天性甲状腺激素合成障碍：
原因：这是由于编码甲状腺激素合成相关酶的基因发生突变，导致甲状腺激素合成过程中某一环节出现障碍，使甲状腺激素合成不足，进而刺激垂体分泌TSH增加，引起甲状腺代偿性增生肿大。
特殊人群特点：患儿从出生后就存在甲状腺激素合成障碍，会严重影响其生长发育，包括身高、智力等方面的发育迟缓，若不及时诊断和治疗，会对患儿的一生造成严重影响，因此对于新生儿进行先天性甲状腺功能筛查非常重要，以便早期发现并干预。
5.其他因素：
遗传因素：某些遗传缺陷可影响甲状腺激素的合成、分泌或作用，使个体更容易发生单纯性甲状腺肿。例如，家族中有甲状腺肿病史的人群，其后代患单纯性甲状腺肿的风险可能相对较高，但具体的遗传模式和相关基因还在进一步研究中。
环境因素：除了碘缺乏或过量等与碘相关的环境因素外，其他环境因素如长期处于污染环境中，可能通过影响甲状腺的正常功能而导致甲状腺肿，但目前相关具体机制还需进一步深入研究。
青春期、妊娠期、哺乳期：在青春期，人体生长发育迅速，对甲状腺激素的需求增加；妊娠期和哺乳期妇女，身体代谢加快，对甲状腺激素的需求也显著增多，若此时机体相对碘不足，就容易发生单纯性甲状腺肿。例如，青春期少年和妊娠期、哺乳期妇女需要特别注意碘的摄入，以满足身体的需求，预防甲状腺肿的发生。
