输卵管妊娠有三大临床表现，一是多数患者有6-8周停经史但部分无明显停经史，年龄、生活方式等影响停经表现判断；二是腹痛为主要症状，未流产或破裂时一侧下腹隐痛或酸胀，流产或破裂时一侧下腹撕裂样痛伴恶心呕吐，内出血多可致全腹痛及放射痛，不同年龄患者耐受及有盆腔炎等病史者反应不同；三是胚胎死亡后有不规则阴道流血，量少点滴状，少数量多似月经，与激素水平下降致子宫内膜剥脱有关，有内分泌疾病等病史者反应不同。
多数患者有6-8周的停经史，但也有部分患者无明显停经史，可能将异位妊娠的不规则阴道流血误认为月经，或由于月经仅过期几日，不认为是停经。年龄、生活方式等因素可能影响停经表现的判断，比如年轻女性生活不规律可能对月经周期影响较大，导致停经史询问不准确；有过输卵管手术史等病史的患者，输卵管结构改变可能影响受精卵正常运行，从而影响停经相关表现。
腹痛
是输卵管妊娠患者的主要症状，在输卵管妊娠发生流产或破裂之前，由于胚胎在输卵管内逐渐增大，常表现为一侧下腹部隐痛或酸胀感。当输卵管妊娠流产或破裂时，突感一侧下腹部撕裂样疼痛，常伴有恶心、呕吐。疼痛的程度和性质与内出血的量及速度等有关，若内出血迅速积聚，刺激腹膜，还可引起全腹疼痛，甚至放射至肩部引起肩胛部放射性疼痛。不同年龄患者对疼痛的耐受程度可能不同，年轻患者可能对疼痛的感知和反应更敏锐；有慢性盆腔炎等病史的患者，其输卵管局部可能已有一定炎症基础，对妊娠引起的输卵管反应可能更敏感。
阴道流血
胚胎死亡后，常有不规则阴道流血，色暗红或深褐，量少呈点滴状，一般不超过月经量。少数患者阴道流血量较多，类似月经。阴道流血是由于胚胎死亡后，激素水平下降，子宫内膜剥脱引起。部分患者可能将阴道流血与正常月经混淆，尤其当月经周期不规律时。有过内分泌疾病等病史的患者，激素水平本身可能不稳定，对输卵管妊娠导致的激素变化反应可能不同，从而影响阴道流血的表现。
