溃疡型肠结核有全身症状、消化道症状及其他表现。全身症状包括长期低热、午后或傍晚开始、次晨可恢复正常，部分为弛张热或稽留热，还有盗汗；消化道症状有右下腹或相应部位隐痛、钝痛，有时进餐诱发，部分呈阵发性绞痛，腹泻与便秘交替，约1/3患者可触及右下腹质地中等、固定伴轻至中度压痛的腹部肿块；其他表现有营养不良及肠道外结核表现，如消瘦、贫血、乏力，儿童影响生长发育，女性月经不调，部分伴肺结核等肠道外结核表现。
发热：多数患者有长期低热，午后或傍晚开始，次晨体温可恢复正常，部分患者可表现为弛张热或稽留热。这与结核分枝杆菌感染后引发的机体免疫反应有关，结核杆菌及其代谢产物作为致热原，刺激机体的体温调节中枢，导致体温调节紊乱而出现发热。在儿童及青少年患者中，由于其机体代谢活跃，免疫反应相对强烈，发热表现可能更为常见且典型。
盗汗：夜间或睡醒时出汗较多，这是因为结核杆菌感染后，机体处于消耗状态，自主神经功能紊乱，导致夜间出汗增多。对于女性患者，由于其生理特点，在结核感染时，盗汗可能与激素水平变化及机体整体代谢情况有关，需要关注其营养状态的维持。
消化道症状
腹痛：多位于右下腹，也可因病变部位不同而出现相应部位的腹痛，疼痛性质多为隐痛或钝痛，有时在进餐时诱发，与进餐引起胃肠反射或肠内容物通过病变部位刺激有关。部分患者可表现为阵发性绞痛，这是由于病变肠段痉挛所致。对于老年患者，其痛觉敏感度可能降低，腹痛表现可能不典型，需结合其他症状综合判断。
腹泻与便秘交替：溃疡型肠结核时，肠道病变导致肠功能紊乱。溃疡形成及炎症刺激使肠黏膜吸收功能障碍，同时肠道蠕动增加，引起腹泻，粪便多为糊样，一般无脓血。而在病变修复期，肠道瘢痕形成导致肠管狭窄，可出现便秘。在儿童患者中，由于其肠道功能发育尚未完全成熟，腹泻与便秘交替的表现可能会影响其营养吸收，需要特别注意其生长发育情况。
腹部肿块：约1/3患者可触及腹部肿块，多位于右下腹，质地中等，比较固定，伴有轻至中度压痛。这是因为肠粘连、肠壁增厚及周围组织粘连形成肿块。对于有既往结核病史的患者，出现腹部肿块时要高度怀疑肠结核复发或病变进展。
其他表现
营养不良：由于长期慢性消耗，患者可出现消瘦、贫血、乏力等表现。尤其是儿童患者，长期营养不良会严重影响其生长发育，导致身高、体重低于同龄人，智力发育也可能受到一定影响。女性患者可能会出现月经不调等情况，这与机体整体营养状态及结核感染对内分泌系统的影响有关。
肠道外结核表现：部分患者可同时伴有肺结核等肠道外结核的表现，如咳嗽、咳痰、咯血等肺结核症状。对于有肠道外结核病史的患者，出现肠道症状时更应警惕肠结核的可能。
