新生儿黄疸的发生原因包括胆红素生成过多、肝脏胆红素代谢障碍、胆汁排泄障碍。胆红素生成过多可因红细胞增多症、血管外溶血、同族免疫性溶血、感染、肠肝循环增加等引起；肝脏胆红素代谢障碍是由于肝细胞摄取胆红素能力低下、肝脏结合胆红素功能不足、肝脏排泄结合胆红素障碍所致；胆汁排泄障碍可见于新生儿肝炎、先天性胆道闭锁、遗传性代谢缺陷病等情况。
一、胆红素生成过多
（一）红细胞增多症
多见于部分足月儿和所有早产儿，由于胎儿在宫内处于相对缺氧状态，导致红细胞增多，出生后过多的红细胞被破坏，使胆红素生成增加。例如相关研究显示，红细胞增多症患儿体内红细胞破坏产生胆红素的量明显高于正常新生儿。
（二）血管外溶血
如头颅血肿、皮下血肿、脐血肿、胎-母输血、胎-胎输血等，这些情况会使胎儿体内的红细胞从血管内转移到血管外，进而被巨噬细胞吞噬破坏，产生大量胆红素。有研究表明，存在血管外溶血的新生儿，其血清胆红素水平升高的风险显著增加。
（三）同族免疫性溶血
常见于ABO血型不合或Rh血型不合等情况。例如ABO血型不合时，母亲体内存在的抗体通过胎盘进入胎儿体内，导致胎儿红细胞被破坏，引发溶血，从而使胆红素生成增多。相关数据统计显示，ABO血型不合引起的同族免疫性溶血在新生儿黄疸中占一定比例。
（四）感染
细菌、病毒等病原体感染可导致新生儿出现败血症等情况，感染会使红细胞破坏加速，同时感染还可能影响肝脏对胆红素的代谢功能，进而使胆红素生成过多。研究发现，感染因素引起的新生儿黄疸，其病情往往相对较重。
（五）肠肝循环增加
新生儿肠道内正常菌群尚未完全建立，导致结合胆红素排出减少，经肠道细菌作用后又被重吸收，使肠肝循环增加，胆红素吸收增多。比如母乳喂养的新生儿，由于其肠道内的β-葡萄糖醛酸苷酶活性较高，可促进结合胆红素水解为未结合胆红素，增加肠肝循环，从而可能导致黄疸加重。
二、肝脏胆红素代谢障碍
（一）肝细胞摄取胆红素能力低下
新生儿出生时肝细胞内Y、Z蛋白含量低，通常在出生后5-10天才达到成人水平，这会影响肝细胞对胆红素的摄取。例如相关实验显示，早产儿肝细胞内Y、Z蛋白含量明显低于足月儿，导致早产儿摄取胆红素的能力更弱，更容易出现黄疸。
（二）肝脏结合胆红素功能不足
肝细胞内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶（UDPGT）的量及活性不足，使未结合胆红素不能充分转化为结合胆红素。该酶在出生后逐渐增加，足月儿一般要3-5天才达到正常水平，早产儿则更低且出现时间更晚。有研究表明，早产儿体内UDPGT活性仅为足月儿的一半左右，这使得早产儿结合胆红素的能力显著下降，更容易发生黄疸。
（三）肝脏排泄结合胆红素障碍
某些病理因素可导致新生儿肝脏排泄结合胆红素的功能出现障碍，使结合胆红素在体内潴留，进而引起黄疸。例如新生儿肝炎综合征时，肝细胞受损，影响了结合胆红素的排泄。
三、胆汁排泄障碍
（一）新生儿肝炎
多由病毒感染引起，如乙型肝炎病毒、巨细胞病毒等。病毒感染导致肝细胞受损，胆管上皮细胞肿胀，使胆汁排泄受阻，胆红素反流入血，引起黄疸。研究发现，由巨细胞病毒感染引起的新生儿肝炎，其黄疸出现的时间相对较早，且病情持续时间较长。
（二）先天性胆道闭锁
这是一种较为严重的胆道发育畸形，可分为肝内型和肝外型。胆道闭锁导致胆汁无法正常排出，胆红素在体内淤积，引起持续性黄疸。目前认为，先天性胆道闭锁可能与胚胎发育过程中胆道发育异常有关，且一旦发生，如不及时治疗，会严重影响新生儿的肝功能及生长发育。
（三）遗传性代谢缺陷病
某些遗传性代谢缺陷病可影响胆汁的排泄，例如α1-抗胰蛋白酶缺乏症等，这些疾病会导致肝细胞内的代谢异常，进而影响胆汁的正常排泄，引起黄疸。
