肺栓塞主要由栓子阻塞肺动脉或其分支引起，常见栓子来源包括下肢深静脉血栓（最常见，因下肢静脉血流缓慢、血管内皮损伤、血液高凝等，长期卧床、骨折、老年人、妊娠期和产褥期女性易发生）、其他静脉血栓（发生率较低）、心脏病（心房颤动、心力衰竭易致心脏内血栓脱落引发）、恶性肿瘤（高凝状态及肿瘤相关因素易致血栓脱落）、妊娠和口服避孕药（妊娠时凝血因子增加等，口服避孕药时雌激素致血液高凝）、创伤（创伤致血管内皮损伤及机体应激致血液高凝）、肥胖（影响血液循环致血流缓慢及血液高凝）、高龄（血管弹性下降等致血液相对高凝）。
下肢深静脉血栓：是肺栓塞最常见的病因。下肢静脉血流缓慢、血管内皮损伤、血液高凝状态等因素易导致下肢深静脉血栓形成。例如，长期卧床的患者，因活动减少，下肢静脉血液回流减慢，容易形成血栓；骨折患者，尤其是下肢骨折，由于创伤及长期制动，也增加了下肢深静脉血栓形成的风险。对于老年人来说，身体机能衰退，血液循环相对较慢，也是下肢深静脉血栓形成的高危人群之一。女性在妊娠期和产褥期，体内激素变化等因素也可能导致血液高凝，增加下肢深静脉血栓形成进而引发肺栓塞的风险。
其他静脉血栓：上肢静脉血栓、盆腔静脉血栓等也可能脱落形成栓子，导致肺栓塞，但相对下肢深静脉血栓来说发生率较低。比如上肢接受过中心静脉置管等操作的患者，可能会引起上肢静脉血栓形成，若血栓脱落也有导致肺栓塞的可能。
心脏病：心房颤动、心力衰竭等心脏病患者，心脏内容易形成血栓，当血栓脱落时可能随血液循环进入肺动脉引起肺栓塞。例如，心房颤动患者，心房失去有效的收缩，血液在心房内淤积，容易形成血栓，血栓脱落后就可能导致肺栓塞。心力衰竭患者心脏泵血功能下降，也可能导致血液瘀滞形成血栓。
恶性肿瘤：恶性肿瘤患者体内存在高凝状态，肿瘤细胞还可能释放一些物质促进血栓形成。同时，肿瘤压迫血管等因素也增加了血栓形成的机会，肿瘤相关的血栓脱落后可导致肺栓塞。例如肺癌、胰腺癌等患者发生肺栓塞的风险相对较高。
妊娠和口服避孕药：妊娠期间女性体内的凝血因子增加，子宫增大压迫下腔静脉，导致静脉回流受阻，容易形成血栓。口服避孕药的女性，由于雌激素的作用，也会使血液处于高凝状态，增加了肺栓塞的发生风险。
创伤：严重的创伤，如骨折、大面积烧伤等，创伤导致血管内皮损伤，同时机体处于应激状态，血液高凝，容易形成血栓，进而可能引发肺栓塞。比如严重的骨盆骨折患者，骨折部位出血及创伤应激等因素易导致血栓形成。
肥胖：肥胖者体内脂肪堆积，会影响血液循环，导致血流缓慢，同时肥胖常伴随代谢异常等，容易引起血液高凝，增加肺栓塞的发生风险。
高龄：随着年龄的增长，血管弹性下降，血管内皮容易受损，机体的凝血和纤溶系统功能也会发生变化，导致血液处于相对高凝状态，老年人发生肺栓塞的几率相对较高。
