肾结核有泌尿系统症状，包括尿频、尿急、尿痛（早期由脓尿刺激膀胱黏膜引起，病情发展加重甚至尿失禁，儿童膀胱挛缩尿频明显）、血尿（多终末血尿，少数全程血尿，老年无痛肉眼血尿需警惕并鉴别）、脓尿（尿液混浊有脓苔，镜下多脓细胞）；有全身症状，如发热（多低热，午后明显，伴盗汗、乏力、消瘦等，儿童精神萎靡、食欲差、生长发育受影响，老年症状不典型易被忽视）、贫血（长期消耗致面色苍白、头晕、心慌等，女性月经时加重）；还有其他症状，部分患者腰部隐痛或胀痛，肾脏积脓或脓肾时腰部可触及肿块，儿童表现哭闹拒动等，男性肾结核常合并附睾结核，附睾肿大、硬结，与阴囊皮肤粘连形成窦道。
尿频、尿急、尿痛：这是肾结核最常见的症状，早期因含有结核杆菌的脓尿刺激膀胱黏膜引起，病情发展到结核性膀胱炎及溃疡时，尿频、尿急、尿痛会加重，甚至出现尿失禁。儿童患者因膀胱挛缩，尿频症状尤为明显，婴幼儿可能表现为排尿哭闹、尿布更换频繁等。
血尿：多为终末血尿，是由于结核性膀胱炎及溃疡在排尿终末时膀胱收缩引起出血所致，少数情况下也可为全程血尿，严重时可出现血块。老年患者出现无痛性肉眼血尿时，需警惕肾结核的可能，同时要与其他泌尿系统疾病相鉴别。
脓尿：尿液混浊，可见絮状脓苔，严重时尿液呈米汤样。镜下可见大量脓细胞，这是因为肾脏及膀胱受到结核杆菌感染后产生大量炎性渗出物。
全身症状
发热：多为低热，午后明显，可伴有盗汗、乏力、消瘦等全身中毒症状。这是由于结核杆菌感染人体后引起的全身性免疫反应。儿童患者可能表现为精神萎靡、食欲减退，生长发育受到影响；老年患者则可能因全身状况较差，发热等症状相对不典型，容易被忽视。
贫血：长期慢性消耗可导致患者出现贫血，表现为面色苍白、头晕、心慌等。女性患者在月经期间可能会加重贫血症状，需要加强营养支持并积极治疗肾结核。
其他症状
腰部症状：部分患者可出现腰部隐痛或胀痛，这是由于结核病变累及肾脏包膜或周围组织引起。当肾脏积脓或发生结核性脓肾时，腰部可触及肿块。儿童患者由于表述不清，可能仅表现为哭闹、拒动等异常表现，家长需提高警惕。
男性生殖系统症状：男性肾结核患者常合并附睾结核，表现为附睾肿大、硬结，可与阴囊皮肤粘连形成窦道。这是因为结核杆菌可通过血行或尿道蔓延至男性生殖系统。
