肝功能异常由多种因素引起，包括药物因素（多种药物可致肝功能异常）、感染因素（病毒性肝炎及其他病原体感染可引发）、酒精因素（长期大量饮酒损伤肝细胞致异常）、自身免疫因素（自身免疫性肝病攻击肝细胞等致异常）、遗传代谢因素（遗传性肝病因代谢障碍等致异常）、不良生活方式因素（肥胖脂肪肝、过度劳累熬夜影响）、其他因素（环境毒素、妊娠相关因素等影响）。
一、药物因素
1.各类药物影响：多种药物可引起肝功能异常，如抗生素中的异烟肼，研究表明异烟肼可能通过干扰肝细胞的代谢过程，导致肝细胞损伤，进而影响肝功能；抗癫痫药苯妥英钠也可能对肝脏产生毒性作用，影响肝脏的正常代谢功能。一些抗肿瘤药物，如甲氨蝶呤，在治疗过程中也有引发肝功能异常的报道，其机制可能与药物对肝细胞的直接毒性以及干扰肝脏的生物合成等过程有关。
二、感染因素
1.病毒性肝炎：乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒等感染是引起肝功能异常的常见原因。以乙型肝炎为例，病毒侵入肝细胞后，在肝细胞内复制，引发机体的免疫反应，导致肝细胞受损，影响肝脏的代谢、合成等功能。丙型肝炎病毒感染后，也会引起肝细胞的炎症和损伤，进而造成肝功能异常，据相关统计，慢性丙型肝炎患者中相当一部分存在不同程度的肝功能指标异常。
2.其他病原体感染：细菌感染如败血症等，病原体产生的毒素可影响肝脏功能；寄生虫感染，如肝吸虫感染，肝吸虫在肝胆管内寄生，会机械性地阻塞胆管，引起胆管炎等，同时其代谢产物等也会损伤肝细胞，导致肝功能异常。
三、酒精因素
1.长期大量饮酒：酒精进入人体后主要在肝脏代谢，乙醇在肝细胞内先经乙醇脱氢酶作用转变为乙醛，乙醛再经乙醛脱氢酶作用转变为乙酸。长期大量饮酒时，乙醇和乙醛的蓄积会对肝细胞造成直接毒性损伤，影响肝细胞的结构和功能，导致肝细胞变性、坏死等，进而引起肝功能异常，如血清转氨酶升高等，长期饮酒还可能引发酒精性脂肪肝、酒精性肝炎甚至酒精性肝硬化等严重肝脏疾病，进一步加重肝功能异常。
四、自身免疫因素
1.自身免疫性肝病：自身免疫性肝炎是由于机体免疫系统错误地攻击自身肝细胞，导致肝细胞炎症、坏死，从而引起肝功能异常。患者体内可检测到自身抗体，如抗核抗体、抗平滑肌抗体等，病情活动时往往伴有血清转氨酶、胆红素等指标的升高。原发性胆汁性胆管炎也是自身免疫性肝病的一种，主要是机体免疫系统攻击肝内小胆管，导致胆管炎症、破坏，胆汁淤积，进而影响肝脏功能，出现肝功能异常，如碱性磷酸酶、γ-谷氨酰转肽酶升高等。
五、遗传代谢因素
1.遗传性肝病：某些遗传性疾病可导致肝功能异常，如肝豆状核变性，是由于基因突变导致铜代谢障碍，铜在肝脏等组织沉积，引起肝细胞损伤和肝脏病变，患者会出现肝功能异常，同时伴有神经系统等多系统的症状；血色病是由于铁代谢异常，过多的铁沉积在肝脏等器官，造成肝细胞损伤和肝脏纤维化等，导致肝功能异常，血清铁、铁蛋白等指标会明显升高。
六、不良生活方式因素
1.肥胖与脂肪肝：肥胖人群中脂肪肝的发生率较高，尤其是腹型肥胖。过多的脂肪在肝脏内堆积，会影响肝细胞的正常结构和功能，导致肝细胞脂肪变性，进而引起肝功能异常，常表现为血清转氨酶轻度升高。肥胖相关的胰岛素抵抗也会参与脂肪肝的发病过程，加重肝脏的损伤。
2.过度劳累与熬夜：长期过度劳累和熬夜会影响机体的正常代谢和免疫功能，肝脏的代谢和修复等功能也会受到影响，可能导致肝功能出现波动。例如，熬夜会打乱肝脏的生物钟，影响肝脏的正常代谢节律，使肝脏的解毒、合成等功能不能正常有序进行，长期如此可能引发肝功能异常。
七、其他因素
1.环境毒素：长期接触某些环境毒素，如黄曲霉毒素，黄曲霉毒素是一种强致癌物质，进入人体后主要在肝脏代谢，可直接损伤肝细胞的DNA等，引起肝细胞的损伤和坏死，导致肝功能异常；工业毒物如四氯化碳等，接触后会通过肝脏代谢，对肝细胞造成严重损伤，引发肝功能异常。
2.妊娠相关因素：妊娠期肝内胆汁淤积症是妊娠中晚期特有的并发症，主要表现为血清胆汁酸升高，进而引起肝功能异常，同时可出现皮肤瘙痒等症状，其发病机制与妊娠期体内激素变化、遗传等多种因素有关，对母婴健康都有一定影响。
