低位肛瘘通常不建议不手术，保守治疗难根治且易复发还可能引发并发症，手术是治愈主要方法，有肛瘘切开术、肛瘘切除术等方式，儿童患者手术需谨慎，老年患者术前要评估控制基础疾病，总体需通过手术解决低位肛瘘问题。
保守治疗的局限性
难以治愈：保守治疗主要包括局部坐浴、使用抗生素等，这些方法只能暂时缓解症状，如减轻疼痛、红肿等，但无法从根本上解决肛瘘内口感染灶的问题，瘘管会持续存在，病情容易反复发作。例如，有研究表明，单纯依靠保守治疗的低位肛瘘患者复发率较高。
可能引发并发症：如果低位肛瘘长期不手术，感染可能会向周围组织蔓延，引起更复杂的肛周感染，如形成肛周脓肿等，增加治疗的难度和患者的痛苦。
手术治疗的必要性及方式
手术的必要性：手术是治愈低位肛瘘的主要方法，通过手术可以切除瘘管，处理内口，促进创面愈合。手术可以一次性解决肛瘘的问题，减少复发的可能性。
常见手术方式
肛瘘切开术：适用于低位单纯性肛瘘，将瘘管全部切开，靠肉芽组织生长使伤口愈合。这种手术方式操作相对简单，能够有效地去除病灶。
肛瘘切除术：对于低位复杂性肛瘘，在切开瘘管后，将瘘管及其周围的瘢痕组织一并切除，然后创面进行缝合或开放。
特殊人群的情况
儿童患者：儿童低位肛瘘相对较少见，但如果发生，由于儿童身体处于生长发育阶段，手术需要更加谨慎。一般来说，也建议尽早手术，因为长期不手术可能会影响肛门的正常发育和功能。但手术方式的选择需要充分考虑儿童的生理特点，尽量选择对肛门功能影响较小的手术方式，同时要注意术后的护理，保持肛周清洁，促进创面愈合。
老年患者：老年低位肛瘘患者可能合并有其他基础疾病，如糖尿病、心血管疾病等。手术前需要对患者的全身情况进行全面评估，控制基础疾病，以降低手术风险。手术方式的选择也要考虑老年患者的身体耐受情况，尽量选择创伤相对较小、恢复相对较快的手术方式，但总体上仍需要通过手术来解决肛瘘问题，因为长期肛瘘不处理也会给老年患者带来较大痛苦和健康风险。
