长期缺铁性贫血对身体多系统有损害，包括血液系统致携氧能力下降等、心血管系统致心脏负担加重等、免疫系统致抵抗力下降等；影响儿童和成人认知功能；使消化系统功能减退；对育龄女性妊娠时自身健康及胎儿发育均不利，可致孕妇并发症增多、分娩风险增加，胎儿宫内发育迟缓等问题。
心血管系统：为了弥补氧气运输的不足，心脏会代偿性地加快跳动，长期如此可能会导致心脏负担加重，引发心脏扩大、心功能不全等问题。成年患者可能会出现心悸、气短等症状，在活动后症状更为明显。对于患有基础心血管疾病的人群，如本身就有冠心病的患者，长期缺铁性贫血会进一步加重心肌缺血缺氧的状况，增加心绞痛发作的频率和心肌梗死的发生风险。
免疫系统：缺铁会影响免疫系统的功能，使机体抵抗力下降，容易发生各种感染性疾病。例如，儿童长期缺铁性贫血时，呼吸道感染的发生率会显著高于正常儿童，因为免疫系统功能受影响后，身体抵御细菌、病毒等病原体的能力减弱。
对认知功能的影响
儿童认知发育：在儿童时期，大脑处于快速发育阶段，长期缺铁性贫血会影响神经系统的发育，导致儿童认知功能受损，表现为注意力不集中、记忆力减退、学习能力下降等。有研究发现，缺铁性贫血的儿童在语言表达、数学运算等认知测试中的得分明显低于正常儿童。这是因为铁是神经系统发育所必需的元素，缺铁会影响神经递质的合成和神经元的正常功能，从而阻碍儿童的认知发展。
成人认知功能：对于成年人，长期缺铁性贫血也会对认知功能产生不良影响，导致思维迟缓、反应速度减慢等。例如，从事需要高度注意力和快速反应能力工作的人群，如司机等，长期缺铁性贫血可能会增加工作中的风险，因为其认知功能受损会影响对路况等信息的处理和反应速度。
对消化系统的影响
消化功能减退：长期缺铁性贫血会影响消化系统的功能，导致消化腺分泌减少，胃肠蠕动减慢。患者可能会出现食欲不振、腹胀、便秘等症状。例如，部分患者会感觉对食物缺乏兴趣，进食量减少，进而影响营养物质的摄入，形成恶性循环，进一步加重贫血状况。对于老年人，本身消化功能就相对较弱，长期缺铁性贫血会使消化系统的功能进一步恶化，可能会导致营养不良的情况更加严重。
对妊娠的影响（针对育龄女性）
孕妇自身健康：育龄女性长期缺铁性贫血在妊娠期间会加重身体的负担，增加妊娠并发症的发生风险，如妊娠期高血压疾病的发生率可能会升高。同时，孕妇在分娩过程中也会面临更大的风险，如产后出血的可能性增加，因为缺铁会影响凝血功能相关物质的合成。
胎儿发育：对胎儿的生长发育也极为不利，可能导致胎儿宫内发育迟缓、早产、胎儿窘迫等情况。胎儿在子宫内得不到充足的氧气和营养供应，会影响其器官的发育，尤其是神经系统的发育可能会受到严重影响，出生后的婴儿可能存在智力发育障碍等问题。
