每天半夜三四点大便可能和生理性因素有关，也可能是肠易激综合征、肾阳虚等疾病引起的。
1.生理性因素
部分人群可能会养成每天半夜三四点大便的排便习惯，其粪便黄软且成型，这种情况是属于正常的，一般不会影响人体的健康。但是不建议养成半夜三四点大便的习惯，以免影响睡眠质量，尽量调整排便时间。
2.肠易激综合征
肠易激综合征可能是因为内脏高敏感性、胃肠动力异常、神经系统异常等因素引起的，也可能是因为肠道感染、肠道微生态失衡、精神心理障碍等因素引起的，慢性应激、食物不耐受、外科手术等因素也会加重此疾病。患者由于排便习惯改变，从而出现每天半夜三四点大便的症状。
3.肾阳虚
肾阳虚是由于素体阳虚、年高肾亏、久病伤肾、房劳过度等因素造成的，患者因夜晚体内阳气不足，不能温养脾胃，从而出现每天半夜三四点大便的情况。
