羊水穿刺16周做与18周做主要区别为成功率，怀孕16周时羊水穿刺成功率低，怀孕18周时做羊水穿刺成功率较高。
怀孕时间是根据末次月经计算，部分女性由于月经周期紊乱，导致实际孕周小于16周，此时胎儿较小，羊水量也较少，这时进行羊水穿刺可能会误伤胎儿，并且羊水中有关胎儿的脱落细胞较少，不能提取足够的培养量，容易导致培养失败，因此，怀孕16周进行羊水穿刺成功率较低。
而怀孕18周的孕妇羊水量增加，在穿刺时可以起到保护胎儿及缓冲的作用，不容易误伤胎儿，且这个时间段羊水中所含有的胎儿脱落细胞较多，容易提取足够的量进行培养，且细胞容易培养成活，因此怀孕18周时进行羊水穿刺的成功率较高。
