亚急性甲状腺炎根据病程分为早期、中期、恢复期，不同时期的症状也会有明显差别。
1、早期症状：早期会因为体内甲状腺激素合成过多出现甲状腺毒症，表现为发热、烦躁、出汗增多、食欲增加等。典型症状是脖子疼痛，触摸可发现肿大的甲状腺，质地较硬，有明显压痛感。疼痛还会向耳后、下颌等部位放射。
2、中期症状：主要以甲状腺功能减退症状为主，如记忆力下降、心动过缓、精神低迷、乏力等。
3、恢复期症状：上述症状逐渐改善，甲状腺结节、肿大逐渐消失，个别病例会遗留有小结节，以后慢慢吸收。大多患者甲状腺功能恢复症状，少数患者可持续存在甲状腺功能减退症。
