肺泡蛋白沉积症的诊断方法是体格检查、实验室检查、影像学检查、病理检查等，具体如下：
1.体格检查
对于出现面部发绀、杵状指、肺部湿啰音的患者，需要考虑患有肺泡蛋白沉积症。
2.实验室检查
其可以采取血常规，其可以明确是否出现感染、贫血的情况；还可以做生化功能检查，帮助辅助判断病因。
3.影像学检查
如胸部X线，其可以观察是否有双肺对称性改变，还可以做胸部HRCT观察肺部情况，有利于对于病因、病情的判断。
4.病理检查
肺泡蛋白沉积症还可以做支气管肺泡灌洗，其可能会发现灌洗液出现不同程度的浑浊，在离心后出现沉淀物等情况。
