角膜炎、结膜炎是两种疾病，但处理方式均包括一般治疗、药物治疗、手术治疗等。
1、一般治疗
对于有明确诱发因素的角膜炎患者，应遵医嘱尽量避免诱因；结膜炎患者除了要去除病因外，还应注意保持眼部的清洁卫生，多卧床休息，避免过度用眼。
2、药物治疗
细菌性角膜炎、结膜炎，可在医生指导下使用红霉素、左氧氟沙星、妥布霉素等抗生素进行抗感染治疗；
病毒性角膜炎、结膜炎，需要使用阿昔洛韦、更昔洛韦、伐昔洛韦等药物进行抗病毒治疗；
真菌性角膜炎、结膜炎，则需要使用两性霉素B、那他霉素、咪康唑等药物进行抗真菌治疗。
3、手术治疗
对于药物治疗无效的角膜炎，可考虑做角膜移植术；发生结膜瘢痕的结膜炎，可采取切除术等，以得到理想的疗效。
