二阶四阶九阶宫颈癌疫苗区别是预防的HPV亚型和疾病,二价宫颈癌疫苗预防HPV16/18亚型,主要预防宫颈癌、癌前病变。四价宫颈癌疫苗预防HPV6/11/16/18亚型,九价宫颈癌疫苗可以预防HPV6/11/16/18/31/33/45/52/58亚型,四价、九价还可以预防尖锐湿疣、外阴癌、阴道癌、肛门癌等疾病。二阶四阶九阶宫颈癌疫苗的适用年龄不同,二阶适用年龄为9~45岁,四价适用年龄为20~45岁,九价适用年龄为16~26岁。此外,接种程序也有不同,二价推荐接种方案:0、1、6月,四价以及九价的接种方案:0、2、6月。