接种流感疫苗对自身免疫性疾病系统危害较小，甚至有益，但特殊人群需注意，接种后需观察30分钟。
根据已知信息，接种流感疫苗对自身免疫性疾病系统的危害较小，甚至可能有益。但在接种前，以下特殊人群需要特别注意：
患有急性疾病、严重慢性疾病、慢性疾病的急性发作期、感冒和发热者，待痊愈后可以补种。
患有未控制的癫痫和其他进行性神经系统疾病者，有格林巴利综合征病史者，应禁忌接种流感疫苗。
疫苗接种后，需要在接种地点观察30分钟。
以下是对答案的具体分析：
1.接种流感疫苗可能会对自身免疫性疾病系统产生一定影响，但总体来说危害较小。
研究表明，接种流感疫苗不会增加自身免疫性疾病的发病风险。
相反，一些研究甚至发现，接种流感疫苗可能对某些自身免疫性疾病有一定的保护作用。
2.特殊人群在接种流感疫苗时需要特别注意。
患有急性疾病、严重慢性疾病、慢性疾病的急性发作期、感冒和发热者，待痊愈后可以补种。
患有未控制的癫痫和其他进行性神经系统疾病者，有格林巴利综合征病史者，应禁忌接种流感疫苗。
3.疫苗接种后，需要在接种地点观察30分钟。
综上所述，接种流感疫苗对自身免疫性疾病系统的危害较小，但特殊人群需要特别注意。在接种疫苗后，需要在接种地点观察30分钟，以确保身体没有不适反应。
