临床上百日咳一般分为邪犯肺卫型痰火阻肺型气阴耗伤型，中医可以在辨证指导下分别选用桑菊饮桑白皮汤合葶苈大枣泻肺汤人参五味子汤合沙参麦冬汤等中药进行治疗。
1.邪犯肺卫型：症见初起流鼻涕咳嗽咽喉红肿，2-3天后咳嗽加重，日轻夜重，痰液较稠，色黄或者白等，可以选用桑菊饮，起到宣肺止咳疏风解表的功效，但是风寒感冒患者不宜使用。
2.痰火阻肺型：症见阵发性咳嗽，伴有吸气时鸡鸣样吼声，吐出痰涎后声音停止，胁痛（胁肋部位疼痛），呕吐，衄血，吐血等，可以选用桑白皮汤合葶苈大枣泻肺汤，起到清泄肺热化痰降逆的功效，脾胃虚寒（脾胃虚弱寒冷）患者慎用。
3.气阴耗伤型：症见咳嗽缓解，鸡鸣样吼声消失，咳嗽无力，自汗（白天不自主地出汗，稍动出汗就加重）或盗汗（入睡后汗出异常，醒来后汗出停止）等，可以选用人参五味子汤合沙参麦冬汤，起到润肺止咳益气养阴（补益气机，补养阴液）的功效，感冒患者慎用。
百日咳的患者要注意休息，室内要保持空气流通，不要进食刺激性食物，百日咳患者使用中药之前，需要有专业中医师的辨证指导，不要盲目用药，以免延误病情。
