针刺镇痛的科学原理是针刺信号与伤害性的痛觉信号相互作用，达到止痛作用，针刺时还会释放一些镇痛物质。
针灸包括针法（俗称针刺）和灸法，常常两者并称为针灸，其中有镇痛作用的是针刺，叫做针刺镇痛。针刺镇痛指的是在经络腧穴或者一定部位，给予毫针针刺刺激，以达到止痛的效果。
现代医学认为，针刺信号是通过穴位深部的感受器及神经末梢的兴奋传入中枢的。针刺引起的传入冲动进入脊髓后，主要交叉到对侧脊髓腹外侧束上行，与痛温觉的传导途径相似，这为针刺信号与痛信号在传入过程中相互作用提供了形态学基础。针刺信号沿着传入神经进入脊髓，与来自疼痛部位的伤害性信号发生相互作用。针刺信号与疼痛信号在脑干水平的整合，针刺信号沿着腹外侧索进入延髓网状结构的巨细胞核，引起该核团的单位放电变化，伤害性刺激信号也可到达巨细胞核，这两种信号可以会聚于同一核团同一细胞，经过相互作用，伤害性刺激引起的反应受到抑制。痛觉和针感都是进入意识领域的感觉，从理论上说，传递这些感觉的传入冲动，必然会投射到大脑皮层，并在那里进行相互作用和整合，达到镇痛的作用。针刺镇痛时，脑内阿片肽释放增加，其中β~内啡肽和脑啡肽在脑内具有很强的镇痛效应，脑啡肽与强啡肽在脊髓内有镇痛作用。
