新生儿肺炎治好后，大多数情况下不会留下显著的后遗症。然而，若病情严重，可能会出现不同程度的长期影响。
如果新生儿肺炎是由细菌、病毒或支原体等引起的轻度感染，经过治疗，通常能够完全康复，不会留下后遗症。
若病情严重，合并呼吸衰竭，需要长时间使用呼吸机或高浓度氧气治疗，可能会导致新生儿后期出现视网膜病变、支气管肺发育不良等问题。
如果新生儿肺炎同时合并有败血症或脑膜炎等严重感染，可能会对神经系统造成损害，进而可能引发惊厥、智力障碍、癫痫、肢体瘫痪等神经系统后遗症。
新生儿肺炎的早期症状有时并不明显，且病情变化迅速，有可能出现呼吸困难、呼吸暂停等危险状况。在极端情况下，这种病状甚至可能对肺部造成不可逆的损害，危及生命。因此，当家长观察到新生儿出现咳嗽、发热等异常症状时，应立即寻求医疗帮助，以防止病情恶化，避免给患儿带来不可逆的伤害。
