疱疹性咽峡炎和手足口病的区别主要在于临床表现、感染病毒和疾病的严重程度。
1.临床表现
疱疹性咽峡炎主要表现为口腔颊黏膜和咽峡部出现疱疹，并伴有发热症状；而手足口病除了口腔部位，还会在手、脚等部位出现疱疹，并且可能伴随有重症表现，如脑干脑炎、抽风、惊厥、心血管系统不稳定以及神经性肺水肿等。
2.感染病毒
疱疹性咽峡炎主要由柯萨奇病毒感染引起，而手足口病虽然也可能由柯萨奇病毒感染，但部分是由肠道病毒感染引起，尤其是重症手足口病多由肠道病毒导致。
3.疾病的严重程度
疱疹性咽峡炎相对较为温和，传染性较小，基本不会危害到患者的生命安全；而手足口病可能会引发脑炎、心肌炎等并发症，有可能导致患者死亡。
