慢性嗜酸性粒细胞性肺炎的病因尚不明确，主要考虑和自身免疫异常、寄生虫、药物所致的变态反应等有关。
1、自身免疫异常
慢性嗜酸性粒细胞性肺炎可能是一种自身免疫性疾病，患者由于自身免疫系统缺陷导致病原体入侵时无法起到防御作用，进而引发慢性嗜酸性粒细胞性肺炎。
2、寄生虫
钩虫、蛔虫等寄生虫感染时，寄生虫可能会通过血液循环侵犯肺部组织，引发过敏性反应，从而导致慢性嗜酸性粒细胞性肺炎。
3、药物所致的变态反应
长期使用四环素、甲氨蝶呤、异烟肼、阿司匹林等药物会造成肺部嗜酸性粒细胞增多，引发变态反应，进而产生慢性嗜酸性粒细胞性肺炎。
