重度萎缩性胃炎的诊断方法是实验室检查、内镜检查、影像学检查、病理学检查等。
一、实验室检查
1、幽门螺杆菌检测
患者可以进行尿素碳13或碳14呼气试验，对其呼出的气体进行分析，判断其是否存在幽门螺杆菌感染的情况。
2、幽门螺杆菌快速尿素酶试验
患者还可以采用幽门螺杆菌快速尿素酶试验的方法进行检查，观察试剂的颜色是否出现变化，出现颜色变化的情况时，一般可以明确病因。
3、胃酸检查
患者进行胃酸检查时，医生可以根据其体内胃酸的水平判断胃泌酸的功能，患者的胃窦部位发生重度萎缩性胃炎的情况时，其可表现为胃酸水平正常或偏低；自身免疫性重度萎缩性胃炎患者则表现为无胃酸分泌，有助于明确病变部位。
4、抗体检测
患者进行抗体检测时，医生可以根据其体内的抗壁细胞抗体、胃泌素分泌细胞抗体以及内因子抗体水平的测定，明确重度萎缩性胃炎的类型。
二、内镜检查
患者进行胃镜检查时，医生可在镜下发现其存在黏膜红白相间的表现，胃黏膜皱襞较为平整，可以初步诊断重度萎缩性胃炎。
三、影像学检查
1、超声检查
患者进行超声检查时，如果其存在胃蠕动速度减慢、黏膜变薄、胃壁层次较为清晰的情况，一般提示其存在萎缩性胃炎的情况。
2、X线检查
患者进行X线检查时，医生可以通过观察其胃的形态、功能以及与周围器官的关系，判断其是否存在重度萎缩性胃炎的情况。
四、病理学检查
医生对患者胃黏膜组织进行病理学检查时，如果发现其存在固有腺体萎缩严重的情况，则可以确诊重度萎缩性胃炎。
