新生儿肺炎若不治会带来诸多严重后果，包括呼吸功能进行性恶化，引发多器官功能损害（心血管系统、神经系统、消化系统等），感染扩散与全身感染，还会影响生长发育，导致体重增长缓慢、身高发育落后等，严重威胁新生儿生命及健康成长。
引发多器官功能损害
心血管系统：缺氧会导致新生儿体内的酸碱平衡失调，进而影响心血管系统，可能出现心率失常、血压波动等情况，严重时可引发心力衰竭。因为缺氧会使心肌细胞的代谢受到影响，心脏的泵血功能下降，无法满足机体各器官的血液供应需求。
神经系统：脑部对缺氧非常敏感，新生儿肺炎不治导致缺氧时，容易引起脑细胞水肿、脑功能障碍，出现意识障碍、惊厥等表现。长期的缺氧还可能影响新生儿的智力发育和神经系统的正常功能，对于有早产史或本身存在神经系统发育不完善的新生儿来说，这种影响可能更为显著。
消化系统：缺氧和感染可能会影响胃肠道的血液供应和正常功能，导致新生儿出现腹胀、呕吐、食欲减退等症状，严重时可能引发坏死性小肠结肠炎等严重并发症，影响营养物质的吸收，进一步加重新生儿的营养不良和身体的虚弱状态。
感染扩散与全身感染
新生儿肺炎如果是由细菌等病原体引起，炎症可能会扩散，导致全身感染，引发败血症等严重疾病。病原体及其产生的毒素进入血液循环，会引起全身炎症反应综合征，表现为体温不稳定、白细胞计数异常等，病情进展迅速，可危及新生儿生命。对于免疫力相对低下的新生儿，如低出生体重儿，更容易发生感染扩散和全身感染的情况。
生长发育受影响
长期的肺炎不治疗会使新生儿处于慢性缺氧和营养摄入不足的状态，影响其正常的生长发育。体重增长缓慢、身高发育落后等情况可能会出现，而且身体的免疫力也会持续低下，更容易反复发生感染，形成恶性循环，严重影响新生儿的健康成长，对其未来的身体状况和生活质量都会产生长期的不良影响。
