扁平疣主要由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，尤以HPV-3型常见，可通过直接或间接接触传播；皮肤屏障功能受损、免疫力低下的自身因素及密切接触传播、不良卫生习惯等特定生活方式易增加感染风险，青少年等因皮肤娇嫩或免疫系统不完善等更易感染。
自身因素影响易感性
皮肤屏障功能受损：当皮肤出现微小破损时，如搔抓、摩擦等造成的皮肤轻度损伤，HPV更容易侵入皮肤细胞。青少年由于皮肤较为娇嫩，活动量较大，皮肤容易受到摩擦等损伤，相对来说更容易感染HPV引发扁平疣。
免疫力低下：免疫力较弱的人群，如患有某些慢性疾病（如糖尿病等）、长期使用免疫抑制剂的人以及儿童和青少年（他们的免疫系统尚在发育中，相对不够完善），对HPV的抵御能力较差，更容易感染HPV并患上扁平疣。例如，长期使用糖皮质激素的患者，其免疫功能受到抑制，感染HPV后发生扁平疣的几率会增加。
特定生活方式增加风险
密切接触传播风险高：在学校、家庭等人群密集的环境中，由于人与人之间的密切接触频繁，如果有扁平疣患者，就容易造成病毒传播。比如学生之间在教室、宿舍等场所的近距离接触，增加了HPV传播的机会。
不良卫生习惯：不注意个人卫生，如不经常洗手、不更换贴身衣物等，会使皮肤表面容易沾染HPV病毒，增加感染风险。例如，经常在公共泳池游泳但不注意卫生清洁的人，就可能因为接触到被HPV污染的池水而感染。
