单眼上睑下垂的病因包括先天性和后天性因素。先天性因素有遗传因素（部分单眼上睑下垂具遗传倾向，因基因异常致上睑提肌或动眼神经核发育异常）和胚胎发育异常（胚胎发育中动眼神经核发育不良或上睑提肌起源异常等）；后天性因素有神经源性因素（动眼神经麻痹，如颅内动脉瘤、脑外伤等致上睑提肌功能障碍；交感神经疾病，如颈交感神经受损致Horner综合征出现单眼上睑下垂）、肌源性因素（重症肌无力，自身免疫致神经-肌肉接头传递障碍，上睑提肌受累；眼肌营养不良症，遗传性肌肉疾病影响眼部肌肉致上睑下垂）、机械性因素（眼睑本身病变，如肿瘤、外伤后瘢痕；眼眶病变，如占位性病变压迫上睑提肌或相关组织）。
胚胎发育异常：在胚胎发育过程中，如第7周时动眼神经核发育不良，或上睑提肌起源异常等，都可能导致单眼上睑下垂。胚胎发育受多种因素影响，包括孕妇在孕期的感染、接触有害物质等，这些因素可能干扰正常的胚胎发育进程，使得眼部相关结构发育出现偏差，进而引起单眼上睑下垂。
后天性因素
神经源性因素
动眼神经麻痹：多种原因可引起动眼神经麻痹，如颅内动脉瘤、脑外伤、炎症等。动眼神经麻痹会导致其支配的上睑提肌功能障碍，从而出现单眼上睑下垂。例如，颅内动脉瘤压迫动眼神经时，就可能引发相应的神经麻痹症状，包括上睑下垂；脑外伤导致动眼神经受损，也会影响其正常功能，造成单眼上睑下垂。
交感神经疾病：颈交感神经受损可引起Horner综合征，其中也可能出现单眼上睑下垂的表现，常伴有瞳孔缩小等症状。颈交感神经受损的原因有颈部外伤、颈部肿瘤、颈部手术等，这些因素会影响交感神经传导通路，进而导致上睑下垂等症状出现。
肌源性因素
重症肌无力：这是一种自身免疫性疾病，主要是神经-肌肉接头处传递功能障碍。患者的上睑提肌等眼部肌肉可受累，出现单眼或双眼上睑下垂，具有晨轻暮重的特点。其发病机制是体内产生了针对乙酰胆碱受体的抗体，阻碍了神经冲动传递到肌肉，导致肌肉无力，上睑提肌功能受影响而出现下垂。
眼肌营养不良症：是一组遗传性肌肉疾病，可影响眼部肌肉，导致上睑下垂等眼部表现。其遗传方式多样，病情会逐渐进展，肌肉逐渐萎缩无力，上睑提肌功能逐渐减退，从而引起单眼上睑下垂，不同类型的眼肌营养不良症在发病年龄、病情进展速度等方面可能有所不同。
机械性因素
眼睑本身病变：如眼睑肿瘤，包括良性肿瘤（如眼睑血管瘤等）和恶性肿瘤（如眼睑基底细胞癌等），肿瘤增长可导致眼睑重量增加，牵引上睑引起下垂；眼睑外伤后瘢痕形成，瘢痕收缩可牵拉上睑，造成单眼上睑下垂。例如，眼睑被重物砸伤后形成瘢痕，随着瘢痕愈合收缩，就可能影响上睑正常位置，出现下垂情况。
眼眶病变：眼眶内的占位性病变，如眼眶囊肿、眼眶蜂窝织炎等，可压迫上睑提肌或相关组织，导致上睑下垂。眼眶囊肿逐渐增大时，会对周围组织产生压迫作用，影响上睑提肌的正常功能，引起单眼上睑下垂；眼眶蜂窝织炎时，炎症刺激可能导致眼部组织肿胀，进而牵拉上睑出现下垂。
