男性生殖器尖锐湿疣好发于冠状沟等多处，初期为淡红色小丘疹，质地软、顶端尖、形态多样；进展期丘疹增大增多、融合成较大疣体，表面凹凸不平、湿润柔软、易出血，不同部位颜色有别且有相应不适感；免疫功能低下者症状更严重易复发，卫生差者疣体周围皮肤有炎症，尿道口处疣体可致排尿困难等症状。
初期症状：初期通常表现为单个或多个淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，形态上可呈丘疹状、乳头状、菜花状、鸡冠状等。这些小丘疹大小不一，一般如针尖至米粒大小，部分可能逐渐增大增多。例如，在不洁性行为后一段时间，生殖器部位出现细小的、与周围皮肤颜色相近或稍红的小疙瘩，表面不光滑，可能伴有轻微的瘙痒或异物感，但很多人初期可能不太在意。
进展期症状：随着病情进展，丘疹会逐渐增大增多，相邻的丘疹可能相互融合，形成较大的疣体。疣体的表面凹凸不平，湿润柔软，触碰易出血。如果发生在潮湿部位，如包皮内、肛周等，疣体可能因湿润而呈现灰白色或粉红色；如果发生在干燥部位，颜色可能更接近皮肤颜色。比如，冠状沟处的小丘疹逐渐融合成菜花状的较大疣体，表面有颗粒样突起，此时可能会有局部的不适感，如摩擦感、异物感等，在排尿时可能会因疣体受到尿液刺激而产生轻微疼痛或不适。
特殊情况症状：对于有免疫功能低下的男性，如患有艾滋病、长期使用免疫抑制剂等，尖锐湿疣的症状可能会更严重，疣体生长迅速，数量多，范围广，可能累及多个部位，且治疗后容易复发。而对于一些卫生状况较差、不注意生殖器清洁的男性，疣体周围的皮肤可能会出现炎症反应，表现为红肿、疼痛等，增加了局部的不适感和感染风险。另外，发生在尿道口的尖锐湿疣，除了可见疣体，还可能出现排尿困难、尿道分泌物增多等症状，这是因为疣体可能阻塞部分尿道，影响尿液的正常排出。
