扁桃体肥大对身体多方面有影响，在呼吸方面可致气道梗阻、反复呼吸道感染；吞咽方面会引起吞咽困难；发音方面会造成语音异常；还可能对全身健康产生潜在影响，如影响心血管系统、免疫系统等。
反复呼吸道感染：肥大的扁桃体表面容易滋生细菌和病毒，成为感染病灶，导致呼吸道反复感染。儿童由于免疫系统尚未完全发育成熟，更容易受到影响，频繁的呼吸道感染会影响儿童的生长发育，导致体质虚弱。比如，患有扁桃体肥大的儿童可能每年呼吸道感染次数明显多于正常儿童，每次感染的病程也可能更长，需要更多的医疗干预。
吞咽方面的影响
吞咽困难：扁桃体过度肥大时，会影响正常的吞咽功能，儿童可能表现为进食缓慢、咀嚼困难，甚至出现流口水的情况。尤其是在进食固体食物时，这种情况更为明显。长期的吞咽困难可能导致儿童营养摄入不足，影响生长发育。例如，可能会出现体重不增、身高增长缓慢等情况。对于成年人，吞咽困难可能会影响正常的饮食结构，导致营养不均衡。
对发音的影响
语音异常：扁桃体肥大会对发音产生一定影响，可能导致发音含糊不清。儿童时期如果扁桃体肥大影响发音，可能会对其语言发育产生不良影响，导致说话晚、发音不准确等问题，进而可能影响其社交能力和自信心的建立。例如，一些患有扁桃体肥大的儿童在与他人交流时，可能因为发音问题而受到误解，从而影响心理健康。
对全身健康的潜在影响
心血管系统影响：长期的睡眠呼吸暂停和慢性缺氧可能会对心血管系统产生不良影响。有研究表明，扁桃体肥大导致睡眠呼吸暂停的患者，患高血压、心脏病的风险可能增加。例如，长期的缺氧刺激会使血管收缩，血压升高，久而久之可能引发心血管疾病。对于患有扁桃体肥大的人群，尤其是合并有高血压等基础疾病的患者，这种影响更为显著。
免疫系统影响：虽然扁桃体是免疫系统的一部分，但过度肥大的扁桃体作为持续的感染病灶，可能会消耗过多的免疫资源，导致整体免疫系统功能紊乱。儿童时期免疫系统本就相对较弱，扁桃体肥大引起的免疫功能紊乱可能会进一步降低身体的抵抗力，使儿童更容易受到其他疾病的侵袭。
