自体脂肪填充苹果肌通常是安全的，但需由专业医生操作并严格筛选适应症。
自体脂肪填充苹果肌是通过抽取身体其他部位的多余脂肪，经净化处理后得到纯净的脂肪颗粒，再将其注射填充至苹果肌部位，利用自身脂肪组织实现面部轮廓的改善，由于使用的是自身组织，理论上排异反应风险较低。
但是，可能伴随肿胀、感染或脂肪吸收不均等并发症，选择具备脂肪移植资质的医疗机构，可降低脂肪结节、凹凸不平等技术性风险。
特殊情况下可能出现脂肪栓塞、局部坏死等严重并发症，因此术后需密切观察，如出现持续红肿热痛、皮肤发白等缺血表现，需立即就医处理。
