生殖器疱疹治疗包括抗病毒治疗（初始治疗用抗病毒药缩短病程，复发频繁者长期抑制疗法减少复发）、一般治疗（局部护理保持清洁干燥等，生活方式调整注意休息、忌刺激性食物等）及特殊人群注意事项（妊娠期女性用药权衡，新生儿密切观察，免疫功能低下者调整治疗及治基础病提免疫力）
一、抗病毒治疗
（一）初始治疗
对于首次发作的生殖器疱疹，可选用阿昔洛韦等抗病毒药物进行治疗，这些药物能抑制病毒DNA合成，缩短病程，减轻症状。研究表明，早期应用抗病毒药物可使病程缩短，临床症状缓解加快。
（二）复发治疗
对于频繁复发（1年复发6次以上）者，长期抑制疗法可减少复发次数，可用阿昔洛韦等药物，通过抑制病毒复制来减少复发频率，研究显示长期抑制治疗能使复发率降低。
二、一般治疗
（一）局部护理
保持患处清洁、干燥，可降低继发细菌感染的风险。患者应避免搔抓患处，防止水疱破裂后引起感染扩散。对于女性妊娠期生殖器疱疹患者，更要注意局部清洁，因为妊娠期机体免疫状态特殊，局部感染控制不佳可能影响母婴健康。
（二）生活方式调整
患者应注意休息，避免过度劳累，因为劳累可能导致机体免疫力下降，从而诱发或加重生殖器疱疹。同时，要避免食用辛辣刺激性食物，减少对患处的刺激。对于有吸烟、饮酒等不良生活方式的患者，需劝导其戒烟限酒，因为吸烟饮酒会影响机体免疫功能，不利于病情控制。
三、特殊人群注意事项
（一）妊娠期女性
妊娠期生殖器疱疹需要特别关注，抗病毒药物的使用需谨慎权衡利弊。在妊娠早期，应尽量避免使用可能对胎儿有影响的抗病毒药物；妊娠中晚期可根据病情在医生评估后选择合适的抗病毒治疗，以减少新生儿感染的风险。因为妊娠期女性的生理状态特殊，胎儿的健康至关重要，所以用药需严格遵循医疗规范。
（二）新生儿
新生儿感染生殖器疱疹后果严重，母亲患有生殖器疱疹时，在分娩过程中可能将病毒传染给新生儿。因此，对于母亲有生殖器疱疹病史的新生儿，需密切观察，一旦怀疑感染，应及时进行诊断和治疗，因为新生儿免疫系统尚未发育完善，感染后病情进展可能非常迅速。
（三）免疫功能低下人群
如艾滋病患者等免疫功能低下者，生殖器疱疹往往症状更严重，复发频率更高，治疗时除了常规抗病毒治疗外，可能需要调整抗病毒药物的剂量或疗程，同时要积极治疗基础疾病以提高机体免疫力，因为免疫功能低下会使病毒更容易复制和扩散，导致病情难以控制。
