乳头内陷的原因包括先天发育因素（乳腺导管短缩、组织纤维化挛缩、乳头平滑肌发育不良等致青春期逐渐显现）、疾病因素（乳腺疾病如乳房肿瘤、感染性疾病等可引发）、外伤因素（胸部外伤致乳腺导管等受损后期粘连挛缩）、医源性因素（乳房手术、乳腺局部治疗致组织损伤粘连瘢痕形成等）、穿着因素（长期穿紧身内衣压迫影响乳头正常发育）。
疾病因素
乳腺疾病：某些乳腺疾病也可能引发乳头内陷，比如乳房肿瘤。当乳房内的肿瘤生长到一定程度，侵犯乳腺导管、韧带等组织时，就可能导致乳头内陷。例如乳腺癌，癌细胞浸润周围组织，包括乳腺导管，会引起导管缩短，从而牵拉乳头内陷。这种情况在成年女性中需警惕，尤其是有乳腺癌家族史或乳腺出现异常肿块等情况的人群。
感染性疾病：乳房部位的感染性疾病如果没有得到及时有效的治疗，也可能影响乳头的正常形态。比如乳房部位的慢性炎症，长期的炎症刺激可能导致乳腺组织的结构改变，进而影响乳头的位置，引发乳头内陷，但相对来说这种情况较为少见。
外伤因素
胸部外伤可能会损伤乳头及周围组织。例如胸部受到撞击等外伤后，乳腺导管、韧带等组织受损，后期修复过程中可能出现组织粘连、挛缩等情况，从而导致乳头内陷。这种情况在有胸部外伤史的人群中可能发生，不同年龄段都有可能，取决于外伤发生的时间和严重程度。
医源性因素
手术影响：如果因乳腺相关疾病进行过乳房手术，如乳房肿瘤切除术等，手术过程中可能会损伤乳头周围的组织，包括乳腺导管、肌肉等。术后恢复过程中如果出现组织粘连、瘢痕形成等情况，就可能导致乳头内陷。这种情况常见于曾接受过乳房手术的患者，手术方式、范围等都会影响乳头内陷发生的可能性。
乳腺局部治疗影响：一些乳腺局部的治疗，如放射治疗等，在治疗过程中可能会对乳头及周围组织产生损伤，导致组织纤维化等改变，进而引起乳头内陷。接受过乳腺放射治疗的患者需要密切关注乳头的形态变化。
穿着因素
长期穿着过紧的内衣，尤其是青春期女性为了追求身材曲线过早穿着过于紧身的内衣，会对乳头造成持续的压迫，影响乳头的正常发育，导致乳头内陷。这种情况在年轻女性群体中较为常见，由于她们可能不太注意内衣的合适程度，长期的压迫影响了乳头的正常突出。
