直肠癌病因包括家族遗传性因素，如常染色体显性遗传的家族性腺瘤性息肉病易致息肉恶变，由DNA错配修复基因缺陷引起的林奇综合征发病年龄早且具家族聚集性；生活方式因素中长期高脂低纤维饮食会因胆汁酸转化致癌物质及肠道蠕动减慢增加风险，缺乏运动则影响肠道蠕动、代谢免疫易增癌变可能；肠道慢性疾病因素里溃疡性结肠炎长期炎症刺激致上皮异常增生，克罗恩病长期炎症损伤易致细胞变异从而增加发病风险。
一、遗传因素
家族遗传性因素是直肠癌的重要病因之一。例如家族性腺瘤性息肉病（FAP），这是一种常染色体显性遗传性疾病，患者肠道内会出现大量腺瘤性息肉，若不及时干预，随着时间推移，这些息肉很容易发生恶变转化为直肠癌。另外，林奇综合征（遗传性非息肉病性结直肠癌）也与直肠癌密切相关，该综合征是由DNA错配修复基因缺陷引起，使得机体对肠道细胞DNA损伤的修复能力下降，导致肠道细胞异常增殖，增加患直肠癌的风险，这类人群的发病年龄往往相对较早，且具有家族聚集性。
二、生活方式因素
1.饮食结构：长期高脂低纤维的饮食是直肠癌的重要诱因。高脂肪饮食会使肠道内胆汁酸分泌增多，胆汁酸在肠道细菌作用下可转化为致癌物质；而低纤维饮食会导致肠道蠕动减慢，粪便在肠道内停留时间延长，肠道黏膜与致癌物质接触时间增加，从而增加直肠癌发生风险。例如长期偏好红肉、油炸食品等高脂肪食物，同时蔬菜、全谷类食物摄入不足的人群，患直肠癌的几率相对较高。
2.缺乏运动：久坐不动的生活方式会影响肠道蠕动功能，使肠道对废物的排出效率降低，肠道内有害物质积聚时间延长，增加直肠癌发生的可能性。缺乏运动还可能导致机体代谢功能紊乱，影响免疫系统对肠道细胞的监控，进而增加癌变风险。
三、肠道慢性疾病因素
某些肠道慢性疾病若长期不愈，会逐渐发展为直肠癌。例如溃疡性结肠炎，这是一种慢性非特异性肠道炎症性疾病，肠道黏膜长期处于炎症状态，反复的炎症刺激会促使肠道上皮细胞异常增生，增加癌变的几率，病程较长的溃疡性结肠炎患者发生直肠癌的风险明显高于正常人群。另外，克罗恩病等肠道慢性炎症性疾病，也因长期的炎症损伤，使得肠道黏膜不断修复再生，在这个过程中容易出现细胞变异，从而增加直肠癌的发病风险。
