根尖脓肿不治会带来诸多严重后果，包括局部感染扩散加重、引发全身感染、影响邻牙及口腔健康、导致牙齿丧失，儿童因骨组织疏松感染扩散更快，老年人感染控制难，妊娠期女性可能影响胎儿，牙齿缺失还会影响儿童恒牙萌出和排列等。
引发全身感染
感染物质可进入血液循环，导致全身感染。轻者引起发热、乏力等全身症状，患者会感觉身体不适、精神萎靡；重者可引发败血症，这是一种极其严重的全身感染性疾病，会出现高热、寒战、感染性休克等表现，严重威胁生命健康。老年人本身免疫力相对较低，患根尖脓肿不治时，发生全身感染的风险更高，且感染控制相对困难，预后可能较差。
影响邻牙及口腔健康
根尖脓肿长期不处理，炎症可能波及相邻牙齿，导致邻牙也出现牙髓感染、根尖病变等问题，影响邻牙的正常功能和寿命。对于妊娠期女性，根尖脓肿不治引发的全身感染可能影响胎儿健康，增加早产、低体重儿等风险，因为炎症产生的毒素等物质可能通过血液循环影响子宫内的胎儿环境。
导致牙齿丧失
随着根尖脓肿的持续发展，患牙的牙槽骨会不断被破坏，牙齿的支持组织逐渐丧失，最终导致牙齿松动、脱落。儿童处于牙齿替换期，牙齿缺失可能影响恒牙的萌出和排列，导致牙列不齐等问题，对其口腔功能和面部发育都有不良影响。
