例假结束后小腹隐隐作痛的原因包括生理性和病理性因素及其他因素。生理性因素有子宫收缩和盆腔充血消退；病理性因素包含妇科炎症（盆腔炎、子宫内膜炎）、子宫内膜异位症、子宫腺肌病、子宫肌瘤；其他因素有肠道问题（如肠易激综合征）、泌尿系统问题（如膀胱炎）。
一、生理性因素
（一）子宫收缩
例假结束后，子宫可能仍有一定程度的收缩以恢复到未孕状态，这种收缩可能会引起小腹隐隐作痛。一般来说，这种收缩引起的疼痛程度较轻，持续时间较短，多见于正常生理情况，与女性自身的激素变化以及子宫恢复过程有关，不同年龄女性都可能出现，生活方式上通常无特殊诱因，主要是身体自身的生理调整过程。
（二）盆腔充血消退
例假期间盆腔处于充血状态，例假结束后，盆腔充血逐渐消退，在这个过程中可能会出现小腹隐隐不适，这是一种正常的生理过渡情况，各年龄段女性均可发生，生活方式对其影响相对较小，主要与例假期间的生理状态相关。
二、病理性因素
（一）妇科炎症
1.盆腔炎
育龄女性较为常见，病原体感染是主要原因，如淋病奈瑟菌、沙眼衣原体等感染。炎症刺激盆腔组织，可导致例假后小腹隐隐作痛，还可能伴有阴道分泌物增多、异味等症状。年龄上多见于有性生活且性生活活跃的育龄女性，生活方式方面不注意性生活卫生等可能增加患病风险。
2.子宫内膜炎
多由细菌感染引起，尤其是在例假期间或宫腔操作后，例假结束后炎症未完全消退，可出现小腹隐痛，可能伴有异常阴道出血等表现。各年龄段女性均可发生，但育龄女性相对更易出现，宫腔操作史等是常见诱因。
（二）子宫内膜异位症
好发于育龄女性，子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位，例假时异位的内膜也会出血，刺激周围组织引起小腹疼痛，疼痛多呈进行性加重，可能在例假结束后仍持续存在，还可能影响生育，年龄主要集中在育龄期，生活方式上可能与遗传等因素相关，目前具体机制尚不完全明确，但内膜异位是关键因素。
（三）子宫腺肌病
多见于30-50岁经产妇，子宫肌层内的异位内膜腺体在例假时出血，导致子宫肌层膨胀，引起小腹隐痛，常伴有月经量增多、经期延长等症状，年龄主要在生育后的中年女性，与多次妊娠、分娩等子宫损伤有关。
（四）子宫肌瘤
多见于30-50岁女性，肌瘤可能影响子宫收缩或压迫周围组织，例假结束后可能仍有小腹隐痛，还可能出现月经改变、腹部包块等表现，不同年龄女性均可发生，与遗传、激素水平等因素相关。
三、其他因素
（一）肠道问题
如肠易激综合征，可在例假后出现小腹隐痛，疼痛与例假周期可能无直接关联，但例假期间的激素变化等可能诱发或加重肠道症状，各年龄段均可发生，生活方式中饮食不规律等可能是诱因，肠道功能紊乱是主要原因。
（二）泌尿系统问题
如膀胱炎，可出现小腹隐痛，常伴有尿频、尿急、尿痛等症状，各年龄段均可发生，细菌感染是常见原因，卫生习惯等生活方式因素可能影响，女性由于尿道短等解剖特点相对更易患膀胱炎。
