双歧杆菌三联与四联活菌制剂在菌株组成、功效作用、制剂工艺及稳定性等方面存在差异，三联含长双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌，四联在此基础加蜡样芽孢杆菌，四联调节菌群更全面，适应人群有潜在差异，工艺因菌株数调整，四联稳定性要求更严。
功效与作用的细微差别
在肠道菌群调节方面：由于四联制剂多了蜡样芽孢杆菌，蜡样芽孢杆菌可以消耗肠道内的氧气，创造厌氧环境，更有利于肠道内厌氧菌如双歧杆菌等的生长繁殖，可能对肠道菌群的调节作用相对更全面。有研究表明，三联制剂主要通过其所含三种菌株协同作用来改善肠道功能，而四联制剂因为增加了蜡样芽孢杆菌，在改善肠道菌群紊乱导致的腹泻、便秘等问题上，可能会有更广泛的适用场景。比如对于一些因多种因素导致肠道菌群失调较为严重的患者，四联制剂可能能更迅速地重建肠道菌群平衡。
在适应人群上的潜在差异：对于一些免疫功能较低或者肠道菌群失调情况较为复杂的特殊人群，如老年人、长期使用抗生素后肠道菌群紊乱的患者等，四联制剂可能因为其菌株组成的优势，在调节肠道菌群方面有更好的效果。但具体还需根据患者的个体情况来判断，比如老年人可能本身肠道功能逐渐衰退，肠道菌群平衡更容易被打破，四联制剂中额外的蜡样芽孢杆菌可能更有助于维持其肠道微生态环境。
制剂工艺及稳定性等方面
制剂工艺：两种制剂在生产工艺上会根据菌株组成的不同进行相应调整。三联制剂因为菌株数量相对少，在工艺控制上相对简单一些，但四联制剂由于多了一种菌株，需要确保多种菌株在制剂中的存活和稳定性。例如，要保证在储存和运输过程中，各种菌株都能保持一定的活性，以确保药物到达肠道后能发挥作用。
稳定性：从稳定性角度看，四联制剂因为菌株种类更多，可能在储存条件等方面有更严格的要求。比如对温度、湿度等环境因素的耐受性可能与三联制剂有所不同。一般来说，都需要在规定的冷藏条件下保存，以维持菌株的活性，但四联制剂可能对储存环境的细微变化更为敏感一些。例如，如果储存温度稍有波动，四联制剂中额外添加的蜡样芽孢杆菌可能比三联制剂中的某些菌株更易受到影响，从而影响药物的最终疗效。
