克罗恩病有消化系统症状如腹痛（多在右下腹或脐周，部分有慢性肠梗阻表现）、腹泻（粪便糊状，病变累及下段结肠或直肠可有黏液血便，儿童患者腹泻可致营养不良和生长发育迟缓）、腹部包块（多见于右下腹与脐周，提示肠道病变较严重）；全身症状有发热（间歇性低热或中度热，少数弛张高热伴毒血症）、营养不良（因慢性腹泻等致消瘦、贫血等，影响儿童生长发育）；肠外表现包括口腔黏膜溃疡、皮肤表现（结节性红斑、坏疽性脓皮病）、关节症状（外周关节炎、骶髂关节炎等脊柱关节病）、眼部病变（葡萄膜炎等）；并发症有肠梗阻（纤维组织增生等引起，表现为腹痛等）、腹腔脓肿（发热、腹痛、腹部包块等，肠道炎症穿透肠壁致局部脓肿形成）、肛瘘（肛周流脓、肿痛等，儿童肛瘘护理需注意肛周清洁）、肠穿孔（少见，多发生于重症患者，可引起急性腹膜炎等严重后果）。
腹泻：是常见症状，粪便多为糊状，一般无脓血或黏液。病变累及结肠下段或直肠时，可有黏液血便。腹泻频率因病情轻重而异，轻度患者每日2-4次，重度患者可达每日10余次。对于儿童克罗恩病患者，腹泻可能导致营养不良和生长发育迟缓，需重视对腹泻情况的监测和干预。
腹部包块：多见于右下腹与脐周，由肠粘连、肠壁增厚、肠系膜淋巴结肿大、内瘘或局部脓肿形成所致。腹部包块的出现提示肠道病变较严重，可能影响肠道的正常蠕动和消化功能。
全身症状
发热：可为间歇性低热或中度热，少数呈弛张高热伴毒血症。发热与肠道炎症活动及继发感染有关。儿童克罗恩病患者发热可能影响其体温调节和整体健康状况，需注意观察体温变化及伴随症状。
营养不良：因慢性腹泻、食欲减退及慢性消耗等因素导致，表现为消瘦、贫血、低蛋白血症、维生素缺乏、骨质疏松等。长期营养不良会严重影响儿童患者的生长发育，使其身高、体重增长落后于同龄人。
肠外表现
口腔黏膜溃疡：可见复发性阿弗他溃疡等口腔病变。
皮肤表现：可有结节性红斑、坏疽性脓皮病等。结节性红斑多见于下肢，表现为红色疼痛性结节；坏疽性脓皮病则可出现皮肤溃疡等。
关节症状：可发生外周关节炎，以大关节受累为主，呈非对称性、游走性。部分患者还可能出现骶髂关节炎等脊柱关节病表现。对于儿童患者，关节症状可能影响其活动能力和运动发育。
眼部病变：如葡萄膜炎、虹膜睫状体炎等。
并发症表现
肠梗阻：是克罗恩病常见并发症，多由纤维组织增生、肠粘连等引起，表现为腹痛、呕吐、腹胀及停止排气排便等。
腹腔脓肿：可出现发热、腹痛、腹部包块等，是肠道炎症穿透肠壁引起局部脓肿形成所致。
肛瘘：为病变穿透肠壁至肛周组织形成，表现为肛周流脓、肿痛等，儿童肛瘘患者护理需特别注意保持肛周清洁，避免感染加重。
肠穿孔：较少见，多发生于重症患者，可引起急性腹膜炎等严重后果。
