阴茎短小的治疗包括药物、手术及非手术辅助改善方式。药物治疗对雄激素水平正常者效果有限，雄激素水平偏低者需评估后谨慎使用雄激素类药物；手术有阴茎延长术（切断韧带增外露长度，有风险且效果因人而异）和阴茎增粗术（自体组织移植或人工材料植入，有吸收、感染等风险）；非手术辅助改善包括心理调节（疏导压力焦虑）和生活方式调整（合理饮食、适度运动，对阴茎短小直接治疗作用有限但有益整体健康），治疗需据个体情况综合评估，青少年不建议过早有创治疗。
一、药物治疗
目前针对阴茎短小的药物治疗，临床上缺乏非常有效的特异性药物。雄激素水平正常的阴茎短小患者，一般不建议药物促进阴茎增长。而对于雄激素水平偏低的患者，可在医生评估下考虑使用雄激素类药物，但需严格把握适应证，因为滥用可能带来一系列副作用，且药物治疗效果有限，并非普遍适用的有效治疗手段。
二、手术治疗
1.阴茎延长术
原理：通过切断阴茎浅、深悬韧带，使埋藏在体内的阴茎海绵体部分释放出来，从而增加阴茎的外露长度。该手术有一定的适应证，一般要求阴茎发育基本正常，勃起功能良好的成年患者。
风险与效果：手术有一定的失败风险，可能出现出血、感染、阴茎勃起功能障碍等并发症，而且术后阴茎延长的效果因人而异，一般可延长3-5厘米左右，但并非所有患者都能达到理想效果。
2.阴茎增粗术
原理：主要有自体组织移植增粗和人工材料植入增粗等方法。自体组织移植增粗是取患者自身的脂肪、筋膜等组织移植到阴茎根部以达到增粗目的；人工材料植入则是将硅胶等假体材料植入阴茎来增粗。
风险与效果：自体组织移植增粗可能存在吸收问题影响效果，人工材料植入有发生感染、排异反应等风险，增粗效果也因个体差异和手术方式不同而有所不同。
三、非手术的辅助改善方式
1.心理调节
对于因阴茎短小产生心理压力、焦虑等情绪的人群，尤其是成年患者，心理因素可能会进一步影响性生活质量等。应进行积极的心理疏导，让患者正确认识阴茎短小的相关知识，避免过度焦虑，保持良好的心态，这对整体的身心健康和可能存在的性生活状况有一定的积极作用。特别是青少年人群，若因对自身身体发育的担忧产生心理问题，家长和医生应及时给予正确引导。
2.生活方式调整
合理饮食：保证营养均衡，摄入富含蛋白质、维生素、矿物质等营养物质的食物，如瘦肉、鱼类、新鲜蔬菜水果等，这对身体的整体发育包括生殖系统的健康有一定的基础保障作用，但对于阴茎短小本身的直接治疗作用有限。例如，蛋白质是身体组织修复和生长的重要原料，维生素和矿物质参与多种生理代谢过程，对维持身体正常功能有益。
适度运动：适当进行有氧运动，如跑步、游泳等，有助于提高身体素质，促进血液循环，但对阴茎短小的直接治疗作用不明显。不过良好的身体素质有助于维持整体健康状态，间接可能对生殖系统功能有一定的积极影响。青少年时期适度运动对身体发育有好处，成年后适度运动也有助于保持身心健康。
需要注意的是，阴茎短小的治疗需要根据个体的具体情况综合评估，患者应在正规医院就诊，由专业医生根据患者的年龄、身体状况、病史等制定个性化的治疗方案，同时要充分了解各种治疗方式的风险和效果，谨慎选择。对于青少年患者，不建议过早进行有创的手术等治疗，应先观察身体发育情况，因为部分青少年可能在青春发育期还会有一定的发育变化。
