早上起来小腿酸痛可能由多种因素引起，运动相关因素包括无氧运动过量和运动姿势不当；疾病因素有腰椎间盘突出症、下肢血管病变、关节炎；其他因素包含寒冷刺激、营养不良、睡眠姿势不良。
一、运动相关因素
1.无氧运动过量：如果前一天进行了大量无氧运动，比如高强度的深蹲、慢跑等，小腿肌肉在无氧代谢下会产生乳酸堆积。乳酸堆积会刺激肌肉内的神经末梢，从而引起酸痛。例如，长时间没有运动的人突然进行较长时间的登山活动，很容易出现小腿酸痛。
2.运动姿势不当：运动时姿势不正确，会使小腿肌肉受力不均，局部肌肉过度紧张或拉伤，也会导致早上起来小腿酸痛。比如跑步时步伐过大且落地重心不稳，会加重小腿肌肉的负担，引发酸痛。
二、疾病因素
1.腰椎间盘突出症：当腰椎间盘突出压迫到支配小腿的神经时，可能会引起小腿酸痛，同时还可能伴有下肢麻木、无力等症状。这种情况在长期久坐、弯腰工作的人群中较为常见，年龄较大、有腰椎间盘退变病史的人风险更高。
2.下肢血管病变：如下肢静脉曲张，会影响下肢血液循环，导致小腿血液回流不畅，早上起来可能出现酸痛、肿胀等表现；下肢动脉粥样硬化闭塞症也会因动脉狭窄或闭塞，使小腿供血不足，引起酸痛，尤其在行走一段距离后酸痛会加重，休息后可缓解，这种情况在有高血压、高血脂、糖尿病等基础疾病的人群中更易发生。
3.关节炎：例如类风湿关节炎，可累及膝关节周围组织，也可能放射到小腿引起酸痛，同时有关节晨僵、肿胀等表现；骨关节炎随着年龄增长，关节软骨磨损，也可能导致小腿相关部位出现酸痛不适。
三、其他因素
1.寒冷刺激：夜间睡眠时小腿保暖不当，受寒冷刺激后，小腿肌肉会发生痉挛性收缩，导致局部血液循环不畅，早上起来就会感觉小腿酸痛。尤其是在秋冬季节，睡眠时没有盖好被子，小腿暴露在外，更容易出现这种情况。
2.营养不良：缺乏某些营养素，如钙、维生素D等，会影响肌肉的正常功能，导致小腿酸痛。钙是肌肉收缩舒张所必需的元素，维生素D有助于钙的吸收，长期挑食、节食的人容易出现这种情况。
3.睡眠姿势不良：长时间保持不良的睡眠姿势，如长时间压迫小腿，会影响小腿的血液循环，进而引起早上起来小腿酸痛。比如睡眠时总是蜷曲腿部，使小腿肌肉处于紧张受压状态。
