肿瘤十二项包含多种项目及意义，不同项目对应不同肿瘤等情况，不同人群中意义有别，检查时指标异常需结合多方面进一步明确诊断，不能仅凭一项指标异常确诊或忽视其意义。
甲胎蛋白（AFP）：主要用于原发性肝癌的辅助诊断，也是监测肝癌治疗效果及复发的重要指标。在生殖细胞肿瘤如睾丸癌、卵巢癌等以及孕妇血清中也可能升高，孕妇血清AFP升高是正常的生理现象，但如果明显异常升高需警惕相关肿瘤情况。
糖类抗原125（CA125）：对卵巢癌的诊断有较高价值，在其他如胰腺癌、乳腺癌、胃癌、肺癌等患者血清中也有一定比例的升高。此外，一些非恶性疾病如盆腔炎、子宫内膜异位症等也可能引起CA125升高，在女性中需结合临床情况综合判断。
糖类抗原15-3（CA15-3）：是乳腺癌较为重要的标志物之一，在乳腺癌患者中阳性率较高，可用于乳腺癌的辅助诊断、疗效监测及复发转移的监测。其他恶性肿瘤如肺癌、卵巢癌、胰腺癌等也可能有不同程度的升高。
糖类抗原19-9（CA19-9）：对胰腺癌有较高的敏感性和特异性，在胃癌、结肠癌、肝癌等恶性肿瘤中也可升高。一些良性疾病如胰腺炎、胆囊炎等也可能导致CA19-9轻度升高，需注意鉴别。
糖类抗原72-4（CA72-4）：是检测胃癌和各种消化道癌症的重要标志物，对胃癌的诊断特异性较高，在卵巢癌、肺癌等恶性肿瘤中也可能升高。
细胞角蛋白19片段（CYFRA21-1）：是非小细胞肺癌较为特异性的肿瘤标志物，对肺癌的诊断、病情监测及预后评估有一定价值，也可见于其他一些恶性肿瘤如膀胱癌、乳腺癌等。
神经元特异性烯醇化酶（NSE）：是小细胞肺癌的重要标志物，也可见于神经母细胞瘤等疾病。
鳞状细胞癌抗原（SCC）：常用于鳞状细胞癌的辅助诊断和监测，如宫颈癌、肺癌、食管癌等鳞状细胞癌患者血清中可升高。
总前列腺特异性抗原（TPSA）、游离前列腺特异性抗原（FPSA）：主要用于前列腺癌的辅助诊断、早期筛查及前列腺癌病情监测等，FPSA/TPSA比值对鉴别前列腺癌和前列腺良性增生有一定帮助。
人附睾蛋白4（HE4）：是卵巢癌的新标志物，与CA125联合检测可提高卵巢癌早期诊断的准确性。
不同的肿瘤十二项检查项目在不同年龄、性别、生活方式及病史的人群中意义有所不同。例如，对于有肿瘤家族史的人群，定期监测肿瘤十二项可能更有意义；对于吸烟者，CEA的参考范围可能需要综合考虑吸烟因素；孕妇的AFP升高是生理现象，但也需关注是否存在异常情况；有肝脏基础疾病的人群，AFP升高需警惕肝癌可能，但也要排除肝脏良性疾病导致的升高；对于前列腺疾病患者，TPSA和FPSA的检测尤为重要。在进行肿瘤十二项检查时，若发现某项指标异常，需结合临床症状、体征及其他相关检查进一步明确诊断，不能仅凭一项指标异常就确诊肿瘤，也不能忽视指标异常的临床意义。
