胎记的形成与多种因素有关，遗传因素使部分人长胎记概率相对较高；胚胎发育过程中血管发育异常会致血管型胎记，色素细胞异常聚集会致色素型胎记；女性青春期、孕期等特殊时期激素水平变化可能增加长胎记概率；长期紫外线照射会刺激黑素细胞产生更多黑色素增加长胎记风险，环境污染中的化学物质可能干扰胚胎发育致长胎记概率升高。
胚胎发育过程异常
血管发育异常：在胚胎发育的早期，血管系统的形成过程中出现异常。比如，血管瘤的形成可能与胚胎时期血管内皮细胞的异常增殖有关。在胚胎发育到一定阶段时，原本应该退化的血管没有正常退化，或者血管内皮细胞异常增殖，就会导致局部血管畸形或异常聚集，从而形成血管型胎记，如鲜红斑痣等。胎儿在母体内的发育阶段，血管发育异常的情况可能就已经开始出现，不同孕期都可能影响血管的正常发育进而导致胎记形成。
色素细胞异常聚集：对于色素型胎记，如太田痣，是由于胚胎发育时，黑素细胞从神经嵴向表皮移行期间停留在真皮深部而引起。在胚胎发育的特定时期，黑素细胞的迁移出现障碍，导致其在皮肤的特定部位异常聚集，从而形成颜色异常的胎记。这种情况在胎儿的胚胎发育过程中就已发生，不同的胚胎发育阶段对黑素细胞的迁移影响不同，进而影响胎记的形成。
激素水平变化
女性在青春期、孕期等特殊时期，体内激素水平会发生较大变化。在孕期，女性体内雌激素、孕激素等激素水平显著升高，可能会影响皮肤的色素代谢等过程。有研究表明，孕期女性长胎记的概率可能会增加，尤其是一些与激素相关的胎记。青春期时，身体内分泌系统活跃，激素水平波动较大，也可能导致皮肤出现色素沉着等情况从而形成胎记。不同性别在不同生理阶段激素水平变化不同，女性在青春期、孕期等阶段受激素影响长胎记的风险相对较高。
环境因素
紫外线照射：长期暴露在紫外线环境下可能会对皮肤产生影响，增加长胎记的风险。紫外线会刺激皮肤中的黑素细胞，使其产生更多的黑色素。例如，长期在户外活动且没有做好防晒措施的人群，皮肤受到紫外线照射较多，可能更容易出现色素型胎记。不同年龄的人群都可能因紫外线照射而受影响，儿童如果长时间在阳光下暴晒，也可能增加长胎记的可能性，成人长期紫外线暴露同样会有影响。
环境污染：环境污染中的一些化学物质可能会对人体的皮肤发育等产生不良影响。例如，空气中的某些污染物可能会干扰胚胎发育过程中的细胞正常代谢等。在工业污染较为严重的地区，居民接触污染物的机会较多，长胎记的概率可能相对较高。不同生活环境的人群，接触环境污染的程度不同，生活在污染较严重地区的人群长胎记风险可能更高。
