运动神经元病病因未完全明确，可能与遗传因素（约10%-20%患者有家族遗传倾向，如SOD1基因突变可致病）、环境因素（长期接触重金属或营养缺乏相关）、氧化应激与线粒体功能障碍（氧化应激失衡致神经细胞损伤，线粒体功能异常影响能量供应致运动神经元变性死亡）、免疫因素（自身免疫反应可能参与，自身免疫异常人群患病风险高）有关。
约10%-20%的运动神经元病患者有家族遗传倾向。研究发现，超氧化物歧化酶1（SOD1）基因等多个基因的突变与家族性运动神经元病的发病相关。例如，SOD1基因突变可导致酶的结构和功能异常，影响神经细胞的正常代谢和功能，进而引发运动神经元的损伤和变性。不同年龄段的人群，若有家族中运动神经元病患者的病史，其发病风险相对增加。对于有家族遗传史的人群，应密切关注自身身体状况，定期进行神经功能方面的检查。
环境因素
重金属暴露：长期接触铅、汞等重金属可能与运动神经元病的发病有关。研究表明，重金属可干扰神经细胞内的氧化还原平衡、影响神经递质的合成和传递等，从而对运动神经元产生毒性作用。从事相关职业（如采矿、蓄电池生产等）且长期处于重金属暴露环境中的人群，患运动神经元病的风险可能升高。这类人群应加强职业防护，减少重金属的接触。
营养因素：某些营养素的缺乏或不均衡也可能与运动神经元病的发生存在关联。例如，维生素E、维生素B族等营养素具有抗氧化、维护神经细胞正常功能等作用，长期缺乏这些营养素可能增加运动神经元受损的风险。老年人由于消化吸收功能下降等原因，相对更容易出现某些营养素的缺乏，应注意保持均衡的饮食，确保摄入足够的营养物质。
氧化应激与线粒体功能障碍
氧化应激：正常情况下，体内的氧化与抗氧化系统处于平衡状态。但在运动神经元病患者中，存在氧化应激失衡的情况，过多的氧自由基产生，而抗氧化能力相对不足，氧自由基可损伤神经细胞的细胞膜、蛋白质和核酸等，导致运动神经元的损伤。年龄增长会使机体的抗氧化能力逐渐下降，可能更易受到氧化应激的损伤，增加运动神经元病的发病风险。
线粒体功能障碍：线粒体是细胞的能量工厂，参与能量代谢等重要过程。运动神经元病患者的线粒体存在功能异常，如能量产生不足、线粒体DNA突变等，这会影响神经细胞的正常能量供应和代谢，进而导致运动神经元的变性和死亡。线粒体功能障碍在一些有遗传背景的患者中可能更为突出，不同年龄、不同遗传背景的人群，线粒体功能障碍对运动神经元的影响程度可能有所不同。
免疫因素
部分研究认为，自身免疫反应可能参与了运动神经元病的发病过程。例如，体内可能产生针对运动神经元相关抗原的自身抗体，这些抗体攻击运动神经元，导致其功能受损。免疫系统的异常在不同个体中表现可能不同，一些患有自身免疫性疾病的人群，或者免疫系统功能紊乱的人群，患运动神经元病的风险可能相对较高。对于自身免疫功能异常的人群，需要密切监测神经系统的状况，早期发现可能的运动神经元病相关表现。
