长期服用清宫寿桃丸对健康的利弊需结合个体情况综合判断，总体而言弊大于利，不建议自行长期服用。
该药含驴肾、鹿肾、人参等温补成分，短期服用可改善肾虚衰老引发的腰膝酸软、头晕耳鸣等症状，对中老年体虚者有一定调理作用。但长期服用可能引发上火，出现口干舌燥、咽喉肿痛；部分患者还会因药物刺激胃肠黏膜导致腹胀、腹泻。
需注意，药物代谢依赖肝肾，长期服用可能加重肝肾负担，引发肝功能异常、尿液颜色改变等问题。且其含有的滋补成分可能促进食欲，导致体重增加，甚至引发肥胖、高血压等代谢问题。若需长期使用，必须严格遵循医嘱，定期监测肝肾功能及体重变化，出现异常及时停药就医。
