畸胎瘤的发生与遗传因素、生殖细胞异常分化、内分泌因素、环境因素和免疫因素相关，遗传因素使有家族倾向人群风险更高，生殖细胞异常分化因发育中紊乱所致，内分泌失调影响生殖系统功能，环境中化学物质接触和辐射暴露可增加风险，免疫异常则可能无法清除异常细胞。
生殖细胞异常分化
生殖细胞在正常发育过程中出现异常分化是导致畸胎瘤的重要原因之一。生殖细胞具有向多种组织细胞分化的潜能，当生殖细胞在分化过程中发生紊乱时，就可能形成含有多种组织成分的畸胎瘤。在胚胎发育早期，如果生殖细胞迁移过程出现异常，或者在分化调控环节出现差错，都可能引发生殖细胞的异常分化，最终形成畸胎瘤。这种情况在胚胎发育的关键时期受到一些内外因素干扰时更容易发生，比如母体在孕期接触某些不良环境因素等情况都可能影响生殖细胞的正常分化过程。
内分泌因素
内分泌失调与畸胎瘤的发生也存在一定关联。女性体内激素水平的变化可能影响生殖系统的正常功能，从而导致生殖细胞出现异常。例如，雌激素水平的异常波动可能干扰生殖细胞的分化和发育过程，使得生殖细胞更容易发生异常增殖和分化，进而形成畸胎瘤。在青春期女性、育龄女性以及围绝经期女性等不同生理阶段，由于内分泌状态的变化，其发生畸胎瘤的风险可能会有所不同。处于这些特殊生理阶段的女性需要更加注重自身内分泌的调节，保持良好的生活方式以维持内分泌平衡，降低畸胎瘤的发生风险。
环境因素
化学物质接触：孕期女性接触某些化学物质，如某些工业污染物、农药等，可能增加胎儿患畸胎瘤的风险。这些化学物质可能通过胎盘影响胎儿生殖细胞的发育，干扰正常的分化过程，导致畸胎瘤的形成。例如，长期接触含有苯类等有害物质的工作环境的女性，在孕期如果没有做好防护措施，其胎儿发生畸胎瘤的可能性相对较高。
辐射暴露：过多的辐射暴露也可能是诱因之一。孕妇在孕期接受过量的X射线等辐射，可能会损伤胎儿的生殖细胞，影响其正常发育，增加畸胎瘤的发生几率。因此，孕妇应尽量避免不必要的辐射接触，如减少进行不必要的X线检查等。
免疫因素
机体免疫系统的异常可能在畸胎瘤的发生中起到一定作用。免疫系统功能紊乱时，可能无法正常识别和清除异常分化的细胞，使得这些异常细胞能够持续增殖和分化，最终形成畸胎瘤。例如，一些自身免疫性疾病患者，由于免疫系统攻击自身正常组织的同时，也可能对生殖细胞的正常调控产生影响，从而增加了畸胎瘤的发生风险。对于自身免疫性疾病患者来说，需要积极治疗原发病，维持免疫系统的相对稳定，降低相关肿瘤的发生风险。
