小儿惊厥的原因包括感染性因素和非感染性因素。感染性因素有颅内感染（如化脓性脑膜炎由细菌感染致中枢神经系统炎症引发）和颅外感染（高热惊厥常见，多由上呼吸道感染等急性感染致体温骤升引发）；非感染性因素中颅内疾病有癫痫（遗传、出生脑损伤、脑部肿瘤等致神经元异常放电引发）、颅脑损伤（产伤、车祸等致颅脑损伤引发）；颅外疾病有中毒（误服有毒物质等引发）、代谢紊乱（低血糖、低血钙、低血镁等引发）。
颅外感染：各种感染引起的高热惊厥最为常见，多见于6个月-5岁儿童，常由上呼吸道感染等急性感染性疾病导致体温骤然升高（多在39℃及以上）引发。细菌、病毒等病原体感染人体后，释放毒素等物质，刺激机体产生一系列反应，导致体温调节中枢紊乱，进而引起惊厥。
非感染性因素
颅内疾病
癫痫：是一种常见的神经系统疾病，可由遗传因素引起，如某些基因突变可导致癫痫相关蛋白功能异常；也可由出生时的脑损伤（如缺氧缺血性脑病等）、脑部肿瘤等因素引起。癫痫患儿大脑神经元异常放电，从而引发惊厥发作。不同年龄的小儿癫痫的病因可能有所不同，新生儿期癫痫多与产伤、先天性脑发育异常等有关。
颅脑损伤：如产伤（分娩过程中胎儿头部受到挤压等导致的颅脑损伤）、车祸等外伤引起的颅脑骨折、颅内出血等，损伤脑组织，影响大脑正常功能，导致惊厥发生。
颅外疾病
中毒：误服有毒物质（如农药、灭鼠药等）、食物过敏、药物中毒（如过量使用某些中枢神经兴奋药物等）等。例如，有机磷农药中毒可抑制胆碱酯酶活性，导致乙酰胆碱蓄积，影响神经系统功能，引发惊厥。小儿好奇心强，且对有毒物质的识别能力差，更容易发生中毒相关惊厥。
代谢紊乱：低血糖、低血钙、低血镁等。低血糖常见于新生儿或婴儿，多因喂养不足、糖原储备不足等引起，血糖水平过低影响大脑能量供应，导致惊厥；低血钙可由维生素D缺乏性佝偻病等引起，血钙降低使神经肌肉兴奋性增高，引发惊厥；低血镁常见于早产儿、长期腹泻等情况，血镁降低也可导致神经肌肉兴奋性异常增高而出现惊厥。
