左归丸与右归丸在组成成分、功效主治、适用人群、药性特点上有差异，左归丸主要由熟地黄等组成功效益阴补肾填精补髓用于肾阴亏虚人群药性偏滋阴为纯补之剂，右归丸成分有熟地黄等功效温补肾阳填精止遗用于肾阳不足人群药性偏温阳补阳中配伍补阴之品寓阴中求阳之意。
左归丸：主要由熟地黄、菟丝子、牛膝、龟板胶、鹿角胶、山药、山茱萸、枸杞子组成。熟地黄能滋阴补血、益精填髓；菟丝子可滋补肝肾、固精缩尿；牛膝能补肝肾、强筋骨；龟板胶与鹿角胶分别为滋阴、补阳之要药，协同作用以调整阴阳；山药补脾养胃、生津益肺、补肾涩精；山茱萸补益肝肾、涩精固脱；枸杞子滋补肝肾、益精明目。
右归丸：成分有熟地黄、炮附片、肉桂、山药、酒茱萸、菟丝子、鹿角胶、枸杞子、当归、盐杜仲。熟地黄在此方中同样重要，炮附片、肉桂温补肾阳、温暖脾肾；山药、山茱萸、菟丝子、鹿角胶、枸杞子、杜仲等可补益肝肾、益精养血；当归能补血活血。
功效主治区别
左归丸：功效益阴补肾、填精补髓。临床主要用于真阴不足证，常见症状有头晕目眩、腰酸腿软、遗精滑泄、自汗盗汗、口燥舌干等。从中医理论角度，真阴不足会导致机体失于滋养，出现上述一系列虚损表现，比如肾阴亏虚，不能上荣头目则头晕目眩，不能濡养腰膝则腰酸腿软等。
右归丸：功效为温补肾阳、填精止遗。主治肾阳不足、命门火衰证，症见年老或久病气衰神疲、畏寒肢冷、腰膝软弱、阳痿遗精、或阳衰无子、或饮食减少、大便不实、或小便自遗等。此证多因肾阳亏虚，机体失于温煦，命门火衰，影响生殖、消化等多个系统功能，出现相应虚寒表现。
适用人群差异
左归丸：适用于肾阴亏虚的人群，常见于中年以上因工作压力大、长期熬夜等导致阴液耗损的人群，以及患有一些慢性消耗性疾病出现肾阴不足表现的患者。女性若因久病等出现月经不调、经量少等肾阴亏虚相关表现也可考虑使用，但需在医生指导下。
右归丸：用于肾阳不足的人群，像年老体衰、阳气虚弱明显者，男性出现阳痿、遗精等肾阳不足表现，以及患有一些慢性疾病呈现阳虚症状的患者。女性肾阳不足可能出现宫寒不孕等情况时也可在合适情况下考虑，但同样需专业医生辨证指导。
药性特点差异
左归丸：药性偏于滋阴，以补阴为主，是纯补之剂，对于纯虚证、阴液不足而无明显阳虚表现者较为适宜。
右归丸：药性偏于温阳，以补阳为主，在补阳之中配伍补阴之品，寓“阴中求阳”之意，适用于肾阳不足兼有些许精血不足，但以阳虚表现更为突出的情况。
