孕囊不发育（胚胎停育）核心原因是染色体异常，其次涉及母体、子宫、环境及特殊人群等多因素。
染色体异常（最核心因素）
占早期胚胎停育的50%-60%，包括胚胎自身染色体数目或结构异常（如三体、单体、易位等），多因减数分裂或受精过程中染色体分离错误导致；其次是父母遗传因素，如父母染色体平衡易位、倒位等异常，可能遗传给胚胎。
母体内分泌与免疫紊乱
内分泌失调是重要诱因，如孕酮分泌不足、甲状腺功能异常（甲减或甲亢）会影响胚胎着床；自身免疫性疾病（如抗磷脂综合征）或慢性生殖道感染（如衣原体、支原体感染）会引发免疫攻击或胎盘微循环障碍，导致孕囊停止发育。
子宫结构与环境损伤
子宫解剖异常直接影响胚胎着床：黏膜下子宫肌瘤、宫腔粘连、纵隔子宫等会机械性阻碍胚胎植入或血供；宫颈机能不全（宫颈松弛）虽以中晚期流产为主，但严重病例早期也可能因孕囊支撑不足引发停育。此外，长期接触甲醛、苯等有毒化学物质，或孕期吸烟、酗酒、滥用药物（如某些激素类、化疗药）会损伤胚胎基因组。
特殊人群风险升高
高龄孕妇（≥35岁）染色体异常概率显著增加，需加强产前筛查；多囊卵巢综合征（PCOS）患者因高雄激素、胰岛素抵抗及卵子质量下降，胚胎发育潜能降低；既往反复流产史者应重点排查抗磷脂抗体、凝血功能（如D-二聚体升高），孕期需提前干预（如抗凝治疗）。
生活方式与管理
孕期缺乏叶酸、营养不均衡（如缺铁、维生素D缺乏）会影响胚胎发育；作息紊乱、精神压力大可能通过神经-内分泌轴干扰激素平衡。建议备孕期规范检查（如甲状腺功能、激素水平），孕期避免不良环境，定期产检监测HCG、孕酮及超声，早发现异常及时处理。
