新生儿病理性黄疸有多种表现，包括皮肤巩膜黄染，足月儿超12.9mg/dl、早产儿超15mg/dl时较明显，早产儿黄疸出现早、重、退晚；可致神经系统症状，血清胆红素过高时早期有嗜睡等，进展后有肌张力增高等；伴有消化系统症状，如食欲减退、呕吐、大便颜色改变；感染等原因引起的还伴有原发疾病表现，遗传代谢性疾病导致的有家族史及特定诱因下发病表现。
神经系统症状
当血清胆红素水平过高时，可能会引起神经系统症状。对于新生儿，严重的高胆红素血症可能导致胆红素脑病。早期可能出现嗜睡、反应低下、吸吮无力、拥抱反射减弱等表现。随着病情进展，可能出现肌张力增高、抽搐、角弓反张等情况。这是因为胆红素能透过血-脑屏障，损伤脑细胞。例如，一些研究表明，当未结合胆红素水平达到一定程度时，就会对中枢神经系统产生毒性作用，影响神经细胞的正常代谢和功能。
消化系统症状
病理性黄疸患儿可能伴有消化系统症状，如食欲减退，婴儿可能表现为吃奶量减少。部分患儿还可能出现呕吐，这是因为胆红素代谢异常影响了消化系统的正常功能。此外，有的患儿可能出现大便颜色改变，若为溶血性黄疸，大便可能呈金黄色或陶土色改变，这与胆红素代谢产物的排出异常有关。
其他症状
对于感染等原因引起的病理性黄疸，还可能伴有原发疾病的相关表现，如感染性黄疸可能伴有发热、精神萎靡等全身感染中毒症状。而对于蚕豆病等遗传代谢性疾病导致的病理性黄疸，可能有家族遗传病史相关的表现，并且在食用蚕豆等特定诱因下发病。
