阴超镜检查一般无明显疼痛，多数人仅感轻微不适，个体差异、医生操作熟练程度、自身状态会影响疼痛感受，孕期、绝经后女性及有妇科疾病女性阴超镜检查各有特点，需医生规范操作保障受检者安全。
影响阴超镜检查疼痛感受的因素
个体差异：不同女性的痛觉敏感程度不同，有的女性本身痛觉神经相对不那么敏感，在阴超镜检查时感受到的不适就会较轻；而有的女性痛觉较为敏感，可能会感觉相对明显些。
操作熟练程度：医生操作阴超镜的技术熟练程度也会有影响。经验丰富的医生操作时动作轻柔、熟练，能够更快、更顺利地完成检查，从而减少受检者的不适感觉；如果医生操作不熟练，可能会导致受检者感觉更明显的不适。
自身状态：受检者检查时的身体状态也很重要。比如在月经刚结束不久，阴道相对较为松弛，检查时可能会更顺利，不适感相对较轻；如果处于排卵期等特殊时期，阴道等组织状态可能会有所不同，也可能影响对疼痛或不适的感受。
特殊人群阴超镜检查的情况
孕期女性：孕早期进行阴超镜检查时要谨慎，因为此时胚胎着床还不太稳定，操作不当可能有一定风险，但如果是必要的医学检查，医生会非常轻柔地操作，一般也不会有严重的疼痛等不良后果，主要是要保障母婴安全。对于孕中晚期的女性，阴超镜检查相对来说风险更低一些，不过也需要医生严格规范操作。
绝经后女性：绝经后女性阴道黏膜变薄、弹性下降，在进行阴超镜检查时，医生操作更要轻柔，因为这类人群相对更易出现阴道损伤等情况，但只要操作规范，一般不适感觉也在可承受范围，主要是要避免因操作不当导致阴道损伤等问题。
有阴道炎症等妇科疾病的女性：本身有阴道炎症的女性进行阴超镜检查时，可能会因为炎症导致局部组织敏感，感觉相对更明显的不适，而且检查后要注意预防感染加重等情况，医生也会根据炎症情况采取相应的措施来减轻受检者的不适并进行后续处理。
